35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2834 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 		 283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10968  uracil-DNA glycosylase  55.31 
 
 		 284 aa  337  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3433  hypothetical protein  41.49 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36967  predicted protein  33.71 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.177714  normal  0.228714 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11058  conserved hypothetical protein  26.4 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.800129 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01790  hypothetical protein  23.68 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  26.32 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  21.27 
 
 		 349 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  24.03 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2789  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.91 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0777  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.72 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  23.58 
 
 		 361 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3932  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.79 
 
 		 349 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0335865  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4434  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.79 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5871  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.79 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7647  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic binding protein  25.75 
 
 		 324 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4326  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.79 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1644  twin-arginine translocation pathway signal  26.83 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.76466  decreased coverage  0.00621187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  22.28 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31400  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  25.17 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0670501  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2079  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.32 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0115  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.98 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1528  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.26 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.208633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2063  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  28.1 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.800081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2365  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.28 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.626028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3217  periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein, putative  25.54 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30470  putative periplasmic aliphatic sulfonate-binding protein  24.5 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6753  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.26 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0691662 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6519  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.26 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3293  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.63 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2895  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  26.46 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.528553  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6342  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.26 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.77 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  19.64 
 
 		 346 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>