146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2330 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2330  thiamine biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 303 aa  627  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33535  predicted protein  42.5 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  27.65 
 
 		 323 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  28.42 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  24.04 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  28.07 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.92 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  27.3 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  27.53 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  28.29 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.74 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  26.62 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.62 
 
 		 333 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  27.35 
 
 		 360 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  27.34 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.09 
 
 		 322 aa  99.4  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.09 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.96 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.83 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.63 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.39 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.39 
 
 		 333 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.3 
 
 		 333 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.3 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  27.39 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  27.3 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  27.39 
 
 		 333 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  27.39 
 
 		 333 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  27.27 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  25.65 
 
 		 339 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  26.42 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.68 
 
 		 336 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  25.8 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  26.04 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  23.92 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  23.92 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  24.89 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  20.86 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.3 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  25.21 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  22.19 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  26.47 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3018  NMT1/THI5 like domain protein  26.61 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1941  NMT1/THI5 like domain protein  25.85 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.876036  hitchhiker  0.000270678 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  21.64 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.01 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.64 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  24.91 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.19 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  25.17 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  24.19 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  24.19 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  24.19 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  19.22 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  24.19 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.19 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.19 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.19 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.19 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1669  NMT1/THI5 like domain protein  25.22 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.833326  normal  0.535701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.19 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.15 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  24.88 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  23.64 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.9 
 
 		 1075 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  21.04 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  25.42 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  22.9 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  22.09 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  23.24 
 
 		 778 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.19 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.65 
 
 		 349 aa  57  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  22.57 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  20.92 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  23.74 
 
 		 593 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  24.58 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.35 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.93 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  20.16 
 
 		 587 aa  52.4  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  22.34 
 
 		 334 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  28.57 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  25.11 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  23.73 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.69 
 
 		 332 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  25.74 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  21.85 
 
 		 334 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  22.78 
 
 		 1065 aa  50.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  25.43 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 915 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  20.19 
 
 		 360 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.34 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  25.74 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.63 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  21.28 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  24.47 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  21.03 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  21.28 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.68 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  25 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>