170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2624 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  42.94 
 
 		 1124 aa  837    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 1177 aa  2308    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  79.36 
 
 		 1171 aa  1798    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2627  cyclic nucleotide-binding protein  95.45 
 
 		 168 aa  284  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  29.03 
 
 		 948 aa  168  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  43.17 
 
 		 238 aa  99.8  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  28.71 
 
 		 741 aa  96.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  25.71 
 
 		 720 aa  95.1  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  30.61 
 
 		 711 aa  95.1  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  27.64 
 
 		 367 aa  95.1  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  34.78 
 
 		 736 aa  93.2  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  30.15 
 
 		 709 aa  90.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  38.89 
 
 		 720 aa  85.9  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  29.81 
 
 		 715 aa  84.7  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  26.35 
 
 		 398 aa  84.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  34.91 
 
 		 720 aa  84.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  30.15 
 
 		 698 aa  83.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  25.57 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  33.11 
 
 		 719 aa  82.8  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  31.48 
 
 		 702 aa  82  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  29.41 
 
 		 709 aa  81.6  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  32.62 
 
 		 707 aa  81.6  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  35.29 
 
 		 699 aa  80.9  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  31.79 
 
 		 701 aa  80.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  30.82 
 
 		 701 aa  80.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  28.12 
 
 		 715 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  32.54 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  34.21 
 
 		 701 aa  79  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  33.82 
 
 		 714 aa  76.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  27.45 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  28.42 
 
 		 697 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  30.81 
 
 		 709 aa  73.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  27.96 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  35.94 
 
 		 714 aa  71.6  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  27.47 
 
 		 703 aa  70.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  26.24 
 
 		 1040 aa  67.4  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  30.46 
 
 		 696 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  22.88 
 
 		 721 aa  67  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 225 aa  67  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  31.39 
 
 		 350 aa  67  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  36.15 
 
 		 688 aa  65.9  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  28.27 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.13 
 
 		 419 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.15 
 
 		 506 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 		 308 aa  63.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  26.71 
 
 		 838 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  28.25 
 
 		 528 aa  62.4  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  25.45 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  23.77 
 
 		 241 aa  62.4  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 		 417 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  27.18 
 
 		 847 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  27.18 
 
 		 847 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  27.18 
 
 		 844 aa  60.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  28.79 
 
 		 419 aa  60.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  28.77 
 
 		 824 aa  58.5  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  25.91 
 
 		 482 aa  58.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.03 
 
 		 238 aa  58.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_4561  predicted protein  31.25 
 
 		 121 aa  57  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0295097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  25.88 
 
 		 369 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 409 aa  55.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  35.96 
 
 		 367 aa  55.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.68 
 
 		 1056 aa  55.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  29.79 
 
 		 628 aa  54.3  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.52 
 
 		 408 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  26.15 
 
 		 825 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  28.03 
 
 		 412 aa  53.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  29.71 
 
 		 570 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1178  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 505 aa  53.5  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.811879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.68 
 
 		 220 aa  52.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  25.53 
 
 		 225 aa  52  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2002  cyclic nucleotide-binding protein  28.47 
 
 		 641 aa  51.6  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  26.25 
 
 		 923 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1570  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 424 aa  50.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4914  cyclic nucleotide-binding protein  27.7 
 
 		 943 aa  51.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  30.33 
 
 		 603 aa  51.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.72 
 
 		 1018 aa  51.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  28.77 
 
 		 213 aa  51.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.99 
 
 		 231 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1534  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.52 
 
 		 501 aa  51.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231252  normal  0.283254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  26.15 
 
 		 237 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  34.26 
 
 		 222 aa  50.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 489 aa  50.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  32.26 
 
 		 359 aa  50.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.83 
 
 		 487 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0491  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 410 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0215963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1134  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  22.03 
 
 		 364 aa  50.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.081073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1179  cyclic nucleotide-binding protein  25.69 
 
 		 213 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  22.17 
 
 		 238 aa  50.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.87 
 
 		 235 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0952  cyclic nucleotide-binding protein  31.36 
 
 		 164 aa  50.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.422759  hitchhiker  0.0019689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.87 
 
 		 235 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  25.5 
 
 		 868 aa  49.7  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  25.53 
 
 		 626 aa  50.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0067  cyclic nucleotide-binding protein  27.73 
 
 		 153 aa  49.7  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.821564  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4440  cyclic nucleotide-binding protein  30.71 
 
 		 575 aa  49.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0105368  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  28.17 
 
 		 397 aa  49.3  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  32.26 
 
 		 386 aa  49.3  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 227 aa  49.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29.17 
 
 		 226 aa  48.9  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.86 
 
 		 231 aa  48.9  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>