More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1052 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  90.61 
 
 		 185 aa  347  6e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  67.42 
 
 		 188 aa  251  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1204  peptide deformylase  51.72 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  47.51 
 
 		 211 aa  177  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  46.39 
 
 		 155 aa  127  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  43.56 
 
 		 179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  46.67 
 
 		 154 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  44.81 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  44.44 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  43.2 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  44.81 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  41.42 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  42.21 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  48 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  45.33 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  42.17 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  42.86 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  47.33 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  42.35 
 
 		 172 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0043  peptide deformylase  43.2 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.715813  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  39.25 
 
 		 178 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  40.59 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0073  peptide deformylase  40.57 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  38.67 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  44.29 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  43.95 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  40.36 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  38.76 
 
 		 167 aa  115  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  41.71 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  43.37 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.72 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  42.77 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  41.96 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  40.59 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  44.51 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  37.42 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.22 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  42.77 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.28 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.28 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  42.77 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  44.71 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4639  peptide deformylase  42.42 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  41.18 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.22 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7337  peptide deformylase  41.99 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  41.96 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  42.2 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  39.13 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  42.17 
 
 		 156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  44.22 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  42.17 
 
 		 156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  42.17 
 
 		 156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  43.8 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0803  peptide deformylase  40 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.605811 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  40.48 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  42.17 
 
 		 156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  42.86 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  41.76 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  39.61 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  40.67 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  43.24 
 
 		 171 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  39.55 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  43.03 
 
 		 173 aa  110  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  37.57 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  40 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  37.87 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  41.61 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  42 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  40 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  40.49 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  40.96 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  41.4 
 
 		 180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0081  peptide deformylase  41.76 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.364538  normal  0.0628749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  44.29 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  44.7 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  40.59 
 
 		 175 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  41.57 
 
 		 170 aa  109  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  37.14 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  42.35 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  42.16 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  41.32 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  44.03 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  40.14 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  39.41 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  42.51 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  39.07 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  40.59 
 
 		 168 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2184  peptide deformylase  42.48 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  41.46 
 
 		 147 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  37.21 
 
 		 168 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  39.23 
 
 		 209 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  38.82 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  38.97 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0625  peptide deformylase  41.18 
 
 		 175 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  40.46 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  39.41 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  42.77 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  41.72 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>