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for query gene Rmet_1393 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1941  EmrB/QacA family drug resistance transporter  80.24 
 
 		 493 aa  729    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172476  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1304  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  70.74 
 
 		 485 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153867 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1393  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 508 aa  987    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230951  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  70.53 
 
 		 485 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22372  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1365  putative multidrug resistance-like efflux transmembrane protein  70.76 
 
 		 487 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0907  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.82 
 
 		 496 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.93 
 
 		 497 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4538  major facilitator transporter  55.16 
 
 		 498 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
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NC_007950  Bpro_5562  major facilitator transporter  52.61 
 
 		 502 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.449496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.52 
 
 		 482 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.383869  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.76 
 
 		 543 aa  341  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3362  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.19 
 
 		 539 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3254  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.69 
 
 		 531 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  36.4 
 
 		 523 aa  296  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.76 
 
 		 463 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.4 
 
 		 537 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.86 
 
 		 517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.53 
 
 		 515 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.76 
 
 		 537 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.21 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.91 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.37 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.56 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.37 
 
 		 517 aa  190  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.15 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.3 
 
 		 510 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.08 
 
 		 514 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 523 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
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NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.28 
 
 		 471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.93 
 
 		 529 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.12 
 
 		 519 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.52 
 
 		 579 aa  179  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.16 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
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NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  25.93 
 
 		 465 aa  177  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.43 
 
 		 529 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5006  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.19 
 
 		 513 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.328138  hitchhiker  0.00378398 
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.03 
 
 		 479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.56 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.18 
 
 		 506 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
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NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.86 
 
 		 536 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
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NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  26.42 
 
 		 496 aa  173  5.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.19 
 
 		 532 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.3 
 
 		 570 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.23 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0683901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.59 
 
 		 541 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.24 
 
 		 521 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3377  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 516 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.53 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
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NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.33 
 
 		 635 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_3548  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.481697  normal  1 
 
 
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NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  26.04 
 
 		 490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.24 
 
 		 511 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_2226  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.37 
 
 		 511 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.23 
 
 		 529 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.13 
 
 		 509 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 		 511 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2586  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.81 
 
 		 468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941296  hitchhiker  0.00272882 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0022  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.15 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171163  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.86 
 
 		 534 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 558 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.04 
 
 		 564 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 		 545 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.32 
 
 		 483 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.61 
 
 		 579 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 520 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.63 
 
 		 511 aa  163  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.17 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.96 
 
 		 597 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.98 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3742  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.46 
 
 		 544 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0155097  normal  0.299705 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.98 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.52 
 
 		 599 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.02 
 
 		 514 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.9 
 
 		 599 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.48 
 
 		 493 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.52 
 
 		 599 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.74 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.02 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.29 
 
 		 599 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  27.29 
 
 		 599 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.29 
 
 		 599 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  27.52 
 
 		 599 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.36 
 
 		 531 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.03 
 
 		 539 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 537 aa  160  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.29 
 
 		 599 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.04 
 
 		 531 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27 
 
 		 525 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.17 
 
 		 523 aa  160  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 599 aa  160  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 521 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.477871  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.7 
 
 		 456 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3747  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.93 
 
 		 512 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659077  n/a   
 
 
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