249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7039 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  36.56 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  32.98 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  32.64 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  31.96 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  31.23 
 
 		 289 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  30.69 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  25.76 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  31.12 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  27.43 
 
 		 294 aa  92.8  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 282 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 306 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  32.54 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  29.47 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  26.87 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  26.49 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  28.08 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  30.59 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  27.61 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  27.36 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  28.08 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  31.49 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  26.69 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  28.23 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  26.87 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  27.37 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  30.3 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  23.1 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.91 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.07 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.66 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.66 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  24.92 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  27.68 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  27.5 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  28.66 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  28.91 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  29.93 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  28.52 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  27.85 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  28.04 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  29.38 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.03 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  30.24 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 167 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  25.54 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  28.27 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  28.79 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  24.33 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.01 
 
 		 142 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  28.27 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.05 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.76 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  28.36 
 
 		 150 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  27.2 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  20.65 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  26.47 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  30 
 
 		 145 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.52 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  29.93 
 
 		 187 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  22.38 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  26.11 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  30.99 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.96 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  25.24 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 143 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 143 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  29.89 
 
 		 415 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  25.77 
 
 		 271 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  33.68 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  28.37 
 
 		 149 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  27.4 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 163 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 142 aa  50.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2169  hypothetical protein  25.37 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.199565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  31.07 
 
 		 151 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  30.77 
 
 		 144 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.08 
 
 		 144 aa  49.7  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  29.79 
 
 		 137 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  25.43 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 143 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  27.66 
 
 		 150 aa  49.3  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1469  hypothetical protein  27.08 
 
 		 143 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  24.58 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.25 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 153 aa  49.3  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 319 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 140 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  35 
 
 		 140 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  29.3 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  31.85 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  26.06 
 
 		 143 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  23.83 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>