68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6689 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  91.15 
 
 		 226 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  74.44 
 
 		 224 aa  307  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  65.02 
 
 		 223 aa  289  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  66.82 
 
 		 223 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  68.33 
 
 		 222 aa  272  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  65.92 
 
 		 223 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  68.78 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  66.22 
 
 		 223 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  68.33 
 
 		 222 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  59.19 
 
 		 261 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  59.19 
 
 		 229 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  61.4 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  58.93 
 
 		 229 aa  244  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  60.19 
 
 		 223 aa  244  8e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  58.56 
 
 		 224 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  59.91 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  57.14 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  56.7 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  57.14 
 
 		 241 aa  238  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  55.61 
 
 		 226 aa  228  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  59.17 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  54.59 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  50.89 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  47.35 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  50.89 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  48.18 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  47.98 
 
 		 225 aa  191  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  46.46 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  45.98 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  48.71 
 
 		 258 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  48.5 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  44.39 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  43.3 
 
 		 222 aa  165  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  44.39 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  41.78 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  47.19 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  41.18 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  41.78 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  37.38 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  37.86 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  33.03 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  36.63 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  34.4 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  31.32 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  40.22 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  29.83 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  33.86 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  29.46 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  30.2 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0912  spermidine synthase-like  29.83 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  33.98 
 
 		 320 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1079 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  33.98 
 
 		 320 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  34.13 
 
 		 1078 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  34.13 
 
 		 1078 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  27.2 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3323  hypothetical protein  28.8 
 
 		 310 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810152  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  31.58 
 
 		 520 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  26.04 
 
 		 523 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2319  Spermine synthase  30.48 
 
 		 309 aa  42.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.961165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  31.58 
 
 		 520 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  31.58 
 
 		 520 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  26.97 
 
 		 508 aa  42  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  24.79 
 
 		 304 aa  42  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  30.71 
 
 		 349 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  27.82 
 
 		 312 aa  41.6  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2109  hypothetical protein  30.53 
 
 		 305 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal  0.187601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>