164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0307 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0307  Ku protein  100 
 
 		 284 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0276  Ku protein  88.42 
 
 		 284 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4361  Ku family containing protein  55.67 
 
 		 299 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1426  Ku family containing protein  54.29 
 
 		 294 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198791  hitchhiker  0.00133741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0381  Ku protein  56.54 
 
 		 287 aa  304  9.000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6965  Ku protein  53.96 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4316  Ku family containing protein  53.15 
 
 		 285 aa  299  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1734  Ku protein  53.52 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.675504 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1149  Ku domain-containing protein  53.05 
 
 		 281 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7047  Ku protein  52.36 
 
 		 302 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8015  Ku protein  55.3 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5142  Ku protein  50.79 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2176  Ku domain-containing protein  52.27 
 
 		 267 aa  270  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00076571  normal  0.0371963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1263  Ku domain-containing protein  53.46 
 
 		 267 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2238  Ku protein  50 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0524  hypothetical protein  52.78 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0355  hypothetical protein  43.26 
 
 		 327 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0450  hypothetical protein  42.21 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0391  Ku protein  41.32 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3324  hypothetical protein  41.38 
 
 		 310 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6331  hypothetical protein  39.57 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1875  Ku-like protein  39.86 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0388482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0154  hypothetical protein  39.93 
 
 		 328 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0698  Ku-like protein  40.16 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0577  Ku  40.98 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4172  Ku protein  39.58 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411787  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3871  hypothetical protein  37.99 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3065  hypothetical protein  40 
 
 		 321 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.012759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3491  hypothetical protein  39.04 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3917  hypothetical protein  39.76 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100786  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4302  Ku family containing protein  39.58 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.551773  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1773  Ku protein  39.61 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3686  Ku  37.24 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1151  Ku domain-containing protein  34.87 
 
 		 270 aa  182  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0383  Ku protein  36.47 
 
 		 267 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4314  Ku family containing protein  36.86 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0306  Ku protein  34.09 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1427  Ku family containing protein  33.85 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  hitchhiker  0.00131417 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2175  Ku domain-containing protein  35.11 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0621113  decreased coverage  0.00931596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3981  Ku family containing protein  34.98 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1735  Ku protein  33.21 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.425167 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3906  hypothetical protein  36.19 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0523  hypothetical protein  35.11 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6966  Ku protein  32.32 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5141  Ku protein  32.44 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4362  Ku family containing protein  33.85 
 
 		 269 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7048  Ku protein  32.06 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.711994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2434  Ku domain-containing protein  33.97 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.109903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2607  DNA end-binding protein Ku  33.73 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0275  Ku protein  34.36 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1694  Ku protein  31.92 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0306892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2240  Ku protein  30.55 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.986714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2978  Ku domain-containing protein  32.22 
 
 		 307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2134  Ku protein  29.89 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0189  hypothetical DNA-binding protein  29.5 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1122  hypothetical protein  31.01 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2506  Ku family containing protein  33.09 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3255  hypothetical protein  32.73 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0605236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2656  Ku protein  32.7 
 
 		 282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8016  Ku protein  30.32 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0632763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0997  Ku protein  29.59 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2640  Ku protein  32.7 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536145  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3329  Ku protein  28.32 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0181402  normal  0.3354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5208  Ku protein  32.95 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.381222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0938  Ku family containing protein  32.03 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903247  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4531  Ku protein  29.62 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36760  KU domain-containing protein  29.72 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.648282 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0364  Ku protein  29.25 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1234  DNA end-binding protein Ku  30.77 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0137  Ku protein  30.08 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1209  Ku protein  29.78 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.580217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03400  Ku family containing protein  30.2 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0921  Ku family containing protein  29.89 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.4753  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01770  Ku protein  28.52 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2990  Ku protein  32.16 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  0.987869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1489  DNA end-binding protein Ku  29.57 
 
 		 277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1814  Ku protein  29.57 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0552397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1008  Ku family containing protein  30.83 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.140174  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5475  Ku protein  27.84 
 
 		 347 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0202  Ku protein  27.82 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0376424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3969  Ku domain-containing protein  26.52 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3156  Ku protein  30.84 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0502  Ku protein  28.67 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2003  Ku domain-containing protein  27.45 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0489  Ku protein  28.98 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2119  Ku protein  28.31 
 
 		 343 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4340  Ku protein  28.33 
 
 		 325 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0652  Ku protein  28.23 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1599  Ku protein  28.85 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4423  Ku  28.68 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1902  Ku protein  28.35 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4353  Ku family containing protein  25.09 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.618075 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1728  Ku protein  26.29 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.738787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3465  KU domain protein  27.93 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.674832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3246  Ku  29.62 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1894  Ku domain-containing protein  24.24 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2838  hypothetical protein  28.08 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6341  Ku protein  29.2 
 
 		 335 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.198926 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5611  Ku domain-containing protein  29.2 
 
 		 335 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3084  Ku protein  26.7 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>