164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03400 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_03400  Ku family containing protein  100 
 
 		 273 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2003  Ku domain-containing protein  52.51 
 
 		 280 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1489  DNA end-binding protein Ku  46.43 
 
 		 277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0137  Ku protein  53.05 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0364  Ku protein  50.58 
 
 		 312 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0594  Ku domain-containing protein  45.76 
 
 		 283 aa  262  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1122  hypothetical protein  47.24 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0953  Ku domain-containing protein  45.76 
 
 		 270 aa  255  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0921  Ku family containing protein  39.86 
 
 		 318 aa  231  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.4753  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3719  Ku protein  41.26 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000216795  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2990  Ku protein  42.52 
 
 		 286 aa  229  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  0.987869 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0127  Ku protein  43.02 
 
 		 317 aa  228  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2119  Ku protein  41 
 
 		 343 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3969  Ku domain-containing protein  40.38 
 
 		 344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4353  Ku family containing protein  39.62 
 
 		 344 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.618075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8388  Ku family containing protein  39.3 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.97043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1008  Ku family containing protein  44.87 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.140174  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3805  DNA end-binding protein Ku  39.68 
 
 		 396 aa  215  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.320133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5247  Ku protein  40.58 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0342675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1209  Ku protein  36.63 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.580217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1650  Ku protein  37.23 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.475711  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1902  Ku protein  35.32 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1814  Ku protein  38.74 
 
 		 300 aa  204  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0552397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0045  Ku domainn containing protein  39.62 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0652  Ku protein  34.4 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4108  Ku family containing protein  38.67 
 
 		 391 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.337422 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0124  Ku protein  38.58 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0295  DNA end-binding protein Ku  36.64 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4474  Ku protein  38.18 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.232277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5082  Ku  39.21 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0972  Ku protein  38.18 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0141  Ku protein  38.19 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0719  hypothetical protein  37.59 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0188133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0706  hypothetical protein  38.18 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00186853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0862  Ku protein  38.1 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0771  hypothetical protein  38.18 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.437785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0808  hypothetical protein  38.18 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.813427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0904  Ku protein  38.18 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42744e-43 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4917  Ku domain-containing protein  35.16 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0900  hypothetical protein  38.18 
 
 		 270 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.116189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1234  DNA end-binding protein Ku  35.32 
 
 		 331 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13080  DNA end-binding protein Ku  36.05 
 
 		 332 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.467677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1826  Ku domain-containing protein  34.09 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0521  Ku protein  34.73 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4361  DNA end-binding protein Ku  34.85 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.511078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4447  DNA end-binding protein Ku  34.85 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28682  normal  0.0562745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4741  DNA end-binding protein Ku  34.85 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.079051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1728  Ku protein  40.55 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.738787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2813  Ku protein  36.05 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0938  Ku family containing protein  34.87 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903247  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10955  hypothetical protein  33.71 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01770  Ku protein  36.23 
 
 		 346 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1021  Ku protein  39.83 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0311227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1024  Ku protein  40.17 
 
 		 296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0963  DNA end-binding protein Ku  39.83 
 
 		 296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19810  DNA end-binding protein Ku  34.31 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163829  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2952  Ku protein  35.47 
 
 		 274 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0023428  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2229  Ku protein  34.04 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5475  Ku protein  35.34 
 
 		 347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1176  Ku  34.42 
 
 		 320 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0997  Ku protein  35.82 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4531  Ku protein  33.85 
 
 		 316 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3246  Ku  36.29 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1337  Ku70/Ku80 beta-barrel domain-containing protein  35.52 
 
 		 367 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2607  DNA end-binding protein Ku  33.86 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3113  Ku protein  35.52 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2989  Ku protein  35.52 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0677507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3329  Ku protein  34.62 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0181402  normal  0.3354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3084  Ku protein  38.28 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2838  hypothetical protein  35.36 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1857  Ku domain protein  34.06 
 
 		 333 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.195497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3255  hypothetical protein  36.23 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0605236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07100  DNA end-binding protein Ku  32.62 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2506  Ku family containing protein  36.23 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3156  Ku protein  33.33 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0980  Ku protein  34.44 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3465  KU domain protein  35.48 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.674832  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5611  Ku domain-containing protein  33.33 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36760  KU domain-containing protein  34.19 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.648282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3216  Ku domain-containing protein  34.3 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.437219 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6341  Ku protein  33.33 
 
 		 335 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.198926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0202  Ku protein  31.9 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0376424  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0189  hypothetical DNA-binding protein  35.63 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2640  Ku protein  34.88 
 
 		 273 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536145  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2329  Ku-domain-containing protein  34.3 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831159  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1347  Ku domain-containing protein  31.65 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0473966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6482  Ku domain-containing protein  31.65 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6072  Ku protein  32.34 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0823424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0497  Ku protein  35.23 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1599  Ku protein  34.24 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2656  Ku protein  33.33 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2134  Ku protein  35.25 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0489  Ku protein  32.26 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2613  Ku  36.68 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0502  Ku protein  32.97 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1335  Ku protein  34.07 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3304  Ku domain-containing protein  37.11 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1712  Ku protein  33.46 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.817891  hitchhiker  0.000191736 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2524  Ku domain-containing protein  34.07 
 
 		 347 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000225561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3002  hypothetical protein  35.11 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841521  normal  0.430535 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>