164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1599 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1599  Ku protein  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232487 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1728  Ku protein  47.39 
 
 		 257 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.738787  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0364  Ku protein  39.37 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2003  Ku domain-containing protein  37.65 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1122  hypothetical protein  35.89 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3719  Ku protein  35.71 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000216795  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0953  Ku domain-containing protein  36.14 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1814  Ku protein  38.55 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0552397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1489  DNA end-binding protein Ku  33.33 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0594  Ku domain-containing protein  34.32 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2607  DNA end-binding protein Ku  32.86 
 
 		 290 aa  175  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0137  Ku protein  35.16 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2329  Ku-domain-containing protein  35.88 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831159  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0502  Ku protein  34.49 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36760  KU domain-containing protein  34.88 
 
 		 293 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.648282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03400  Ku family containing protein  34.66 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1857  Ku domain protein  35.5 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.195497 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5611  Ku domain-containing protein  36.54 
 
 		 335 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0489  Ku protein  33.1 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2520  Ku domain-containing protein  33.46 
 
 		 375 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6341  Ku protein  36.15 
 
 		 335 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.198926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2990  Ku protein  34.55 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  0.987869 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6072  Ku protein  36.15 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0823424 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1347  Ku domain-containing protein  36.15 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0473966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6482  Ku domain-containing protein  36.15 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1008  Ku family containing protein  38.2 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.140174  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2119  Ku protein  33.58 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2656  Ku protein  35.83 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1176  Ku  32.16 
 
 		 320 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3216  Ku domain-containing protein  33.45 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.437219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3465  KU domain protein  34.05 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.674832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2246  putative Ku-like DNA-end-binding protein  34.4 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3156  Ku protein  33.7 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0980  Ku protein  34.46 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2640  Ku protein  33.86 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536145  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3246  Ku  35.25 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0921  Ku family containing protein  35.09 
 
 		 318 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.4753  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5475  Ku protein  34.47 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2524  Ku domain-containing protein  31.88 
 
 		 347 aa  148  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000225561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1894  Ku domain-containing protein  29.68 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2506  Ku family containing protein  33.85 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3981  Ku family containing protein  35.86 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4302  Ku family containing protein  34.04 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.551773  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1335  Ku protein  31.85 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0045  Ku domainn containing protein  34.54 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1694  Ku protein  37.74 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0306892  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0963  DNA end-binding protein Ku  35.87 
 
 		 296 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3255  hypothetical protein  32.68 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0605236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2978  Ku domain-containing protein  36.03 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1773  Ku protein  34.38 
 
 		 283 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2613  Ku  33.85 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0652  Ku protein  30.39 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1021  Ku protein  36.15 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0311227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3871  hypothetical protein  33.58 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3329  Ku protein  34.39 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0181402  normal  0.3354 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5082  Ku  34.1 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01770  Ku protein  31.92 
 
 		 346 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1024  Ku protein  35.29 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0025  Ku protein  30.58 
 
 		 301 aa  142  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520285  hitchhiker  0.00000000787139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0141  Ku protein  30.83 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0900  hypothetical protein  29.96 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.116189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3084  Ku protein  35.63 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0997  Ku protein  31.73 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2838  hypothetical protein  31.56 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0355  hypothetical protein  33.7 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8388  Ku family containing protein  32.26 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.97043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4917  Ku domain-containing protein  32.05 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1650  Ku protein  28.31 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.475711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4474  Ku protein  29.21 
 
 		 270 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.232277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1826  Ku domain-containing protein  31.66 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0698  Ku-like protein  32.54 
 
 		 332 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0719  hypothetical protein  29.85 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0188133  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3805  DNA end-binding protein Ku  33.47 
 
 		 396 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.320133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1209  Ku protein  32.32 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.580217  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0154  hypothetical protein  32.86 
 
 		 328 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0450  hypothetical protein  34.78 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0972  Ku protein  29.21 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0497  Ku protein  31.15 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0771  hypothetical protein  29.48 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.437785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0904  Ku protein  29.48 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42744e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0808  hypothetical protein  29.48 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.813427  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3002  hypothetical protein  31.58 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841521  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3324  hypothetical protein  34.25 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0189  hypothetical DNA-binding protein  30.3 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0706  hypothetical protein  29.48 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00186853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0124  Ku protein  30.04 
 
 		 259 aa  136  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4353  Ku family containing protein  32.18 
 
 		 344 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.618075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3969  Ku domain-containing protein  32.95 
 
 		 344 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4172  Ku protein  29.82 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0862  Ku protein  28.84 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4361  DNA end-binding protein Ku  30.89 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.511078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4447  DNA end-binding protein Ku  30.89 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28682  normal  0.0562745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4741  DNA end-binding protein Ku  30.89 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.079051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0295  DNA end-binding protein Ku  33.33 
 
 		 346 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4108  Ku family containing protein  31.32 
 
 		 391 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.337422 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1337  Ku70/Ku80 beta-barrel domain-containing protein  31.37 
 
 		 367 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3113  Ku protein  31.37 
 
 		 368 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2989  Ku protein  31.37 
 
 		 368 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0677507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0391  Ku protein  32.01 
 
 		 331 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2134  Ku protein  29.55 
 
 		 274 aa  133  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>