164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3329 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3329  Ku protein  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0181402  normal  0.3354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0938  Ku family containing protein  52.12 
 
 		 297 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903247  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4423  Ku  42.47 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5208  Ku protein  38.67 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.381222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1489  DNA end-binding protein Ku  39.5 
 
 		 277 aa  195  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2607  DNA end-binding protein Ku  37.76 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0594  Ku domain-containing protein  38.01 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2003  Ku domain-containing protein  35.74 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3719  Ku protein  35.27 
 
 		 285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000216795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1650  Ku protein  37.68 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.475711  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0364  Ku protein  34.68 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1814  Ku protein  40.15 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0552397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0953  Ku domain-containing protein  32.81 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1021  Ku protein  40.09 
 
 		 296 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0311227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03400  Ku family containing protein  34.88 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1024  Ku protein  40 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1122  hypothetical protein  35.43 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0963  DNA end-binding protein Ku  40.09 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3981  Ku family containing protein  40.61 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1008  Ku family containing protein  41.18 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.140174  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5247  Ku protein  37.6 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0342675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0127  Ku protein  37.84 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1694  Ku protein  40.23 
 
 		 285 aa  158  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0306892  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0921  Ku family containing protein  37.21 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.4753  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3491  hypothetical protein  34.24 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4172  Ku protein  32.17 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3686  Ku  35.17 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1728  Ku protein  31.91 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.738787  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0137  Ku protein  33.6 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1209  Ku protein  36.47 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.580217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1234  DNA end-binding protein Ku  35.77 
 
 		 331 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8388  Ku family containing protein  35.94 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.97043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1875  Ku-like protein  34.51 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0388482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3805  DNA end-binding protein Ku  37.8 
 
 		 396 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.320133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0652  Ku protein  34.48 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0521  Ku protein  35.77 
 
 		 393 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0141  Ku protein  35.18 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0124  Ku protein  35.57 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4531  Ku protein  35.45 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2990  Ku protein  36.61 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  0.987869 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0202  Ku protein  35.59 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0376424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4353  Ku family containing protein  36.29 
 
 		 344 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.618075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2119  Ku protein  33.82 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4302  Ku family containing protein  32.29 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.551773  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0189  hypothetical DNA-binding protein  31.06 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0295  DNA end-binding protein Ku  35.77 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4917  Ku domain-containing protein  32.06 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19810  DNA end-binding protein Ku  34.72 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163829  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2978  Ku domain-containing protein  34.93 
 
 		 307 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1902  Ku protein  33.58 
 
 		 330 aa  142  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01770  Ku protein  35.91 
 
 		 346 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36760  KU domain-containing protein  33.11 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.648282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6331  hypothetical protein  32.21 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10955  hypothetical protein  32.06 
 
 		 273 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0502  Ku protein  32.32 
 
 		 304 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3969  Ku domain-containing protein  35.91 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2134  Ku protein  30.68 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1826  Ku domain-containing protein  31.3 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0045  Ku domainn containing protein  34.5 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3156  Ku protein  32.27 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0972  Ku protein  33.2 
 
 		 270 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1894  Ku domain-containing protein  32.65 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0489  Ku protein  32.65 
 
 		 304 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0900  hypothetical protein  33.46 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.116189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2813  Ku protein  32.68 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1599  Ku protein  33.58 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232487 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4474  Ku protein  32.68 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.232277 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0862  Ku protein  32.28 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2952  Ku protein  35.94 
 
 		 274 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0023428  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3454  Ku domain-containing protein  33.19 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2656  Ku protein  32.2 
 
 		 282 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5611  Ku domain-containing protein  33.96 
 
 		 335 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2640  Ku protein  32.82 
 
 		 273 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536145  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0706  hypothetical protein  33.07 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00186853  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2229  Ku protein  31.58 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0771  hypothetical protein  33.07 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.437785  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2246  putative Ku-like DNA-end-binding protein  30.54 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0025  Ku protein  33.22 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520285  hitchhiker  0.00000000787139 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0808  hypothetical protein  33.07 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.813427  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4361  DNA end-binding protein Ku  30.92 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.511078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4447  DNA end-binding protein Ku  30.92 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28682  normal  0.0562745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4741  DNA end-binding protein Ku  30.92 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.079051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0391  Ku protein  33.45 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0904  Ku protein  33.07 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42744e-43 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5142  Ku protein  31.65 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5475  Ku protein  34.34 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0450  hypothetical protein  33.85 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3324  hypothetical protein  33.46 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4361  Ku family containing protein  31.31 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6341  Ku protein  33.58 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.198926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13080  DNA end-binding protein Ku  31.86 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.467677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3113  Ku protein  34.42 
 
 		 368 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2989  Ku protein  34.42 
 
 		 368 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0677507  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7047  Ku protein  32.06 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0719  hypothetical protein  32.68 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0188133  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1337  Ku70/Ku80 beta-barrel domain-containing protein  34.42 
 
 		 367 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1176  Ku  32.23 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0980  Ku protein  33.46 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6072  Ku protein  33.57 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0823424 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6482  Ku domain-containing protein  33.57 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>