165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1151 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1151  Ku domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  545  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4362  Ku family containing protein  61.99 
 
 		 269 aa  346  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1427  Ku family containing protein  59.7 
 
 		 271 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  hitchhiker  0.00131417 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0383  Ku protein  59.18 
 
 		 267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4314  Ku family containing protein  58.05 
 
 		 266 aa  321  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1735  Ku protein  58.67 
 
 		 271 aa  318  7e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.425167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0306  Ku protein  59.48 
 
 		 268 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6966  Ku protein  55.3 
 
 		 275 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2175  Ku domain-containing protein  57.63 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0621113  decreased coverage  0.00931596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0275  Ku protein  57.62 
 
 		 267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2240  Ku protein  55.76 
 
 		 268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.986714 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7048  Ku protein  55.81 
 
 		 270 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.711994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2434  Ku domain-containing protein  56.34 
 
 		 264 aa  297  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.109903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0523  hypothetical protein  57.63 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5141  Ku protein  54.68 
 
 		 270 aa  293  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8016  Ku protein  55.56 
 
 		 273 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0632763  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1875  Ku-like protein  45.15 
 
 		 293 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0388482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6331  hypothetical protein  44.87 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4172  Ku protein  44.24 
 
 		 293 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411787  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3871  hypothetical protein  43.12 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3686  Ku  44.62 
 
 		 291 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0698  Ku-like protein  41.29 
 
 		 332 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0355  hypothetical protein  42.37 
 
 		 327 aa  224  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3491  hypothetical protein  43.94 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0577  Ku  41.57 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0154  hypothetical protein  41.6 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0391  Ku protein  41.2 
 
 		 331 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3917  hypothetical protein  41.22 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3065  hypothetical protein  43.35 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.012759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3324  hypothetical protein  43.02 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0450  hypothetical protein  41.6 
 
 		 333 aa  218  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4302  Ku family containing protein  41.48 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.551773  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1773  Ku protein  39.62 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1734  Ku protein  38.7 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.675504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3906  hypothetical protein  41.35 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2176  Ku domain-containing protein  37.69 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00076571  normal  0.0371963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3981  Ku family containing protein  40.84 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1426  Ku family containing protein  40.6 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198791  hitchhiker  0.00133741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4361  Ku family containing protein  37.55 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1263  Ku domain-containing protein  36.94 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.647128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5142  Ku protein  36.33 
 
 		 304 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0381  Ku protein  37.93 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6965  Ku protein  38.63 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7047  Ku protein  37.45 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1149  Ku domain-containing protein  34.96 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0307  Ku protein  34.87 
 
 		 284 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0276  Ku protein  34.35 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0524  hypothetical protein  37.92 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1694  Ku protein  36.26 
 
 		 285 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0306892  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8015  Ku protein  39.91 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2978  Ku domain-containing protein  37.5 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4316  Ku family containing protein  36.5 
 
 		 285 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0189  hypothetical DNA-binding protein  34.07 
 
 		 284 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2134  Ku protein  33.7 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0938  Ku family containing protein  37.5 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903247  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1902  Ku protein  34.46 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0364  Ku protein  33.98 
 
 		 312 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5611  Ku domain-containing protein  33.21 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6341  Ku protein  33.21 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.198926 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5475  Ku protein  32.1 
 
 		 347 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2238  Ku protein  32.03 
 
 		 287 aa  141  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2246  putative Ku-like DNA-end-binding protein  30.37 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2329  Ku-domain-containing protein  31.7 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831159  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2607  DNA end-binding protein Ku  31.73 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1857  Ku domain protein  29.74 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.195497 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1347  Ku domain-containing protein  31.73 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0473966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6482  Ku domain-containing protein  31.73 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6072  Ku protein  31.73 
 
 		 339 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0823424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0502  Ku protein  31.32 
 
 		 304 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1894  Ku domain-containing protein  30.22 
 
 		 310 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0980  Ku protein  31.44 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0489  Ku protein  30.97 
 
 		 304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3216  Ku domain-containing protein  32.34 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.437219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0025  Ku protein  30.26 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520285  hitchhiker  0.00000000787139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3255  hypothetical protein  31.32 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0605236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3002  hypothetical protein  30.64 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841521  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2506  Ku family containing protein  31.32 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2656  Ku protein  31.03 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2990  Ku protein  31.68 
 
 		 286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  0.987869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1122  hypothetical protein  29.07 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01770  Ku protein  31.34 
 
 		 346 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0953  Ku domain-containing protein  31.15 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3329  Ku protein  32.95 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0181402  normal  0.3354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0921  Ku family containing protein  33.62 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.4753  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1176  Ku  29.52 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0497  Ku protein  30.57 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4108  Ku family containing protein  32.44 
 
 		 391 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.337422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2640  Ku protein  30.65 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536145  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0594  Ku domain-containing protein  30.3 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36760  KU domain-containing protein  31.42 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.648282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1008  Ku family containing protein  35.71 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.140174  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1728  Ku protein  29.23 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.738787  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3805  DNA end-binding protein Ku  33.19 
 
 		 396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.320133 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1599  Ku protein  30.59 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3156  Ku protein  31.03 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4340  Ku protein  29.96 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5247  Ku protein  32.71 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0342675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2813  Ku protein  32.45 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0127  Ku protein  31.72 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2119  Ku protein  31.27 
 
 		 343 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>