164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0938 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_0938  Ku family containing protein  100 
 
 		 297 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903247  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3329  Ku protein  50.53 
 
 		 286 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0181402  normal  0.3354 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4423  Ku  50.77 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5208  Ku protein  49.05 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.381222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1814  Ku protein  48.46 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0552397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2607  DNA end-binding protein Ku  41.44 
 
 		 290 aa  205  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3719  Ku protein  37.1 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000216795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1489  DNA end-binding protein Ku  39.86 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1122  hypothetical protein  39.06 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0594  Ku domain-containing protein  42.41 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5247  Ku protein  38.78 
 
 		 347 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0342675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1008  Ku family containing protein  43.59 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.140174  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2003  Ku domain-containing protein  38.46 
 
 		 280 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0953  Ku domain-containing protein  35.48 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03400  Ku family containing protein  35.02 
 
 		 273 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1021  Ku protein  41.74 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0311227  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01770  Ku protein  36.3 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0921  Ku family containing protein  38.13 
 
 		 318 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.4753  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1024  Ku protein  41.67 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0963  DNA end-binding protein Ku  42.86 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2990  Ku protein  39.53 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  0.987869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0364  Ku protein  35.88 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2119  Ku protein  37.08 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1234  DNA end-binding protein Ku  37.27 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5611  Ku domain-containing protein  38.97 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8388  Ku family containing protein  39.02 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.97043 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6341  Ku protein  38.6 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.198926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0980  Ku protein  38.08 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36760  KU domain-containing protein  37.2 
 
 		 293 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.648282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1347  Ku domain-containing protein  37.55 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0473966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6482  Ku domain-containing protein  37.55 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0502  Ku protein  36.93 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0355  hypothetical protein  37.19 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6072  Ku protein  37.55 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0823424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2952  Ku protein  38.08 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0023428  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1857  Ku domain protein  36.19 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.195497 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0124  Ku protein  37.11 
 
 		 259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0141  Ku protein  36.72 
 
 		 259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5082  Ku  37.1 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1337  Ku70/Ku80 beta-barrel domain-containing protein  39.42 
 
 		 367 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3113  Ku protein  39.42 
 
 		 368 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2989  Ku protein  39.42 
 
 		 368 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0677507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2813  Ku protein  37.11 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0127  Ku protein  37.5 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5475  Ku protein  37.5 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1209  Ku protein  36.43 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.580217  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0045  Ku domainn containing protein  36.72 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2329  Ku-domain-containing protein  36.23 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831159  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4172  Ku protein  32.55 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411787  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1650  Ku protein  36.84 
 
 		 274 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.475711  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3805  DNA end-binding protein Ku  39.27 
 
 		 396 aa  158  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.320133 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0137  Ku protein  34.24 
 
 		 259 aa  158  9e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0489  Ku protein  35.99 
 
 		 304 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2506  Ku family containing protein  37.31 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4302  Ku family containing protein  37.37 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.551773  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3255  hypothetical protein  36.92 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0605236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3491  hypothetical protein  34.81 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0450  hypothetical protein  37.19 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1728  Ku protein  34.24 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.738787  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3686  Ku  35.02 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1902  Ku protein  35.97 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2640  Ku protein  36.92 
 
 		 273 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536145  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1875  Ku-like protein  34.23 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0388482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0652  Ku protein  33.67 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3216  Ku domain-containing protein  37.67 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.437219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19810  DNA end-binding protein Ku  35.19 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163829  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1694  Ku protein  38.26 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0306892  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3084  Ku protein  34.9 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0295  DNA end-binding protein Ku  36.94 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3969  Ku domain-containing protein  35.89 
 
 		 344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6331  hypothetical protein  35.12 
 
 		 293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.120205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0391  Ku protein  36.97 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3156  Ku protein  36.98 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2656  Ku protein  36.54 
 
 		 282 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4353  Ku family containing protein  34.97 
 
 		 344 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.618075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1151  Ku domain-containing protein  37.5 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2978  Ku domain-containing protein  33.83 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10955  hypothetical protein  33.82 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2134  Ku protein  34.31 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0577  Ku  37.98 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0154  hypothetical protein  35.64 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4531  Ku protein  36.43 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2613  Ku  36.54 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0698  Ku-like protein  36.05 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3871  hypothetical protein  33.09 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3454  Ku domain-containing protein  37.66 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0997  Ku protein  32.05 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0189  hypothetical DNA-binding protein  33.94 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0521  Ku protein  35.74 
 
 		 393 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3065  hypothetical protein  36.29 
 
 		 321 aa  148  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.012759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1773  Ku protein  38.08 
 
 		 283 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.155858 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2838  hypothetical protein  34.78 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2229  Ku protein  35.58 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3981  Ku family containing protein  36.9 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1176  Ku  32.67 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4108  Ku family containing protein  34.72 
 
 		 391 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.337422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13080  DNA end-binding protein Ku  34.7 
 
 		 332 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.467677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3917  hypothetical protein  33.85 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0900  hypothetical protein  33.08 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.116189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1894  Ku domain-containing protein  33.11 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566888 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>