164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3454 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3454  Ku domain-containing protein  100 
 
 		 261 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0963  DNA end-binding protein Ku  39.73 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1008  Ku family containing protein  39.41 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.140174  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1814  Ku protein  36.29 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0552397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1021  Ku protein  38.67 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0311227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1024  Ku protein  38.67 
 
 		 296 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0594  Ku domain-containing protein  36.54 
 
 		 283 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2003  Ku domain-containing protein  33.59 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0364  Ku protein  34.66 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0137  Ku protein  33.08 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1337  Ku70/Ku80 beta-barrel domain-containing protein  35.14 
 
 		 367 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3113  Ku protein  35.14 
 
 		 368 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2989  Ku protein  35.14 
 
 		 368 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0677507  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03400  Ku family containing protein  32.22 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0953  Ku domain-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5475  Ku protein  34.22 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0045  Ku domainn containing protein  33.2 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01770  Ku protein  34.81 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5611  Ku domain-containing protein  36.09 
 
 		 335 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1122  hypothetical protein  32.17 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6341  Ku protein  35.65 
 
 		 335 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.198926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0938  Ku family containing protein  36.78 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903247  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1489  DNA end-binding protein Ku  34.52 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1857  Ku domain protein  33.97 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.195497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2607  DNA end-binding protein Ku  34.43 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0980  Ku protein  36 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1347  Ku domain-containing protein  36.36 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0473966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6482  Ku domain-containing protein  36.36 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0025  Ku protein  32.58 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520285  hitchhiker  0.00000000787139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6072  Ku protein  36.52 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0823424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2329  Ku-domain-containing protein  33.97 
 
 		 335 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831159  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3719  Ku protein  33.47 
 
 		 285 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000216795  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0189  hypothetical DNA-binding protein  31.39 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2134  Ku protein  31.39 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0124  Ku protein  32.69 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3246  Ku  34.36 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1650  Ku protein  31.18 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.475711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0997  Ku protein  32.3 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0141  Ku protein  32.31 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0502  Ku protein  34.8 
 
 		 304 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0489  Ku protein  34.8 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3084  Ku protein  34.25 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3329  Ku protein  33.19 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0181402  normal  0.3354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3455  Ku domain-containing protein  32.82 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2613  Ku  33.33 
 
 		 286 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1894  Ku domain-containing protein  31.34 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2656  Ku protein  32.17 
 
 		 282 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2640  Ku protein  31.78 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536145  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3255  hypothetical protein  31.72 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0605236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8388  Ku family containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.97043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1712  Ku protein  29.37 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.817891  hitchhiker  0.000191736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2506  Ku family containing protein  33.09 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3465  KU domain protein  33.48 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.674832  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5082  Ku  32.57 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3216  Ku domain-containing protein  33.88 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.437219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36760  KU domain-containing protein  31.92 
 
 		 293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.648282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2990  Ku protein  32.81 
 
 		 286 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  0.987869 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1728  Ku protein  29.84 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.738787  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1209  Ku protein  31.15 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.580217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3156  Ku protein  31.66 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3002  hypothetical protein  29.32 
 
 		 311 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841521  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1694  Ku protein  33.95 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0306892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2838  hypothetical protein  29.55 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1176  Ku  29.06 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5247  Ku protein  30.22 
 
 		 347 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0342675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0127  Ku protein  29.96 
 
 		 317 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4423  Ku  30.65 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4917  Ku domain-containing protein  28.9 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3981  Ku family containing protein  33.46 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1599  Ku protein  30.83 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4361  DNA end-binding protein Ku  30.42 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.511078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4447  DNA end-binding protein Ku  30.42 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28682  normal  0.0562745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4741  DNA end-binding protein Ku  30.42 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.079051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1826  Ku domain-containing protein  28.9 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10955  hypothetical protein  28.9 
 
 		 273 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4340  Ku protein  31.95 
 
 		 325 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00918042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2524  Ku domain-containing protein  31.7 
 
 		 347 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000225561 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0719  hypothetical protein  27.65 
 
 		 270 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0188133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2229  Ku protein  30.71 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0706  hypothetical protein  27.65 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00186853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0862  Ku protein  28.28 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2978  Ku domain-containing protein  32.44 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1335  Ku protein  31.32 
 
 		 347 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0771  hypothetical protein  27.65 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.437785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0808  hypothetical protein  27.65 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.813427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13080  DNA end-binding protein Ku  29.85 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.467677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0904  Ku protein  27.65 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42744e-43 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2119  Ku protein  29.69 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3805  DNA end-binding protein Ku  31.05 
 
 		 396 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.320133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0497  Ku protein  29.1 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4531  Ku protein  31.01 
 
 		 316 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0921  Ku family containing protein  29.21 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.4753  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1902  Ku protein  29.15 
 
 		 330 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0900  hypothetical protein  26.14 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.116189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0972  Ku protein  26.64 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4474  Ku protein  27.46 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.232277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3304  Ku domain-containing protein  29.84 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1151  Ku domain-containing protein  28.24 
 
 		 270 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2246  putative Ku-like DNA-end-binding protein  28.46 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4302  Ku family containing protein  31.4 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.551773  normal  0.276593 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>