165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0521 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0521  Ku protein  100 
 
 		 393 aa  791    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0295  DNA end-binding protein Ku  84.91 
 
 		 346 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13080  DNA end-binding protein Ku  57.23 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.467677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19810  DNA end-binding protein Ku  61.99 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.163829  hitchhiker  0.00299301 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0652  Ku protein  59.93 
 
 		 295 aa  353  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2229  Ku protein  63.85 
 
 		 274 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0127  Ku protein  49.84 
 
 		 317 aa  324  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07100  DNA end-binding protein Ku  56.72 
 
 		 320 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1826  Ku domain-containing protein  58.65 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4917  Ku domain-containing protein  58.65 
 
 		 306 aa  309  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4361  DNA end-binding protein Ku  58.65 
 
 		 315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.511078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4447  DNA end-binding protein Ku  58.65 
 
 		 315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28682  normal  0.0562745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4741  DNA end-binding protein Ku  58.65 
 
 		 315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.079051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1902  Ku protein  50 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10955  hypothetical protein  56.22 
 
 		 273 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0202  Ku protein  51.87 
 
 		 278 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0376424  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1234  DNA end-binding protein Ku  49.48 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4108  Ku family containing protein  48.55 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.337422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4353  Ku family containing protein  43.61 
 
 		 344 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.618075 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4531  Ku protein  52.71 
 
 		 316 aa  272  9e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3969  Ku domain-containing protein  41.93 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2119  Ku protein  42.81 
 
 		 343 aa  266  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0642435  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0921  Ku family containing protein  42.17 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.4753  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3805  DNA end-binding protein Ku  47.98 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.320133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2990  Ku protein  45.38 
 
 		 286 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.575135  normal  0.987869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1209  Ku protein  43.28 
 
 		 273 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.580217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8388  Ku family containing protein  43.24 
 
 		 293 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.97043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5247  Ku protein  42.32 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0342675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2813  Ku protein  44.11 
 
 		 284 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1122  hypothetical protein  38.31 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1489  DNA end-binding protein Ku  37.64 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2003  Ku domain-containing protein  38.85 
 
 		 280 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0364  Ku protein  30.16 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0594  Ku domain-containing protein  39.19 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0137  Ku protein  37.16 
 
 		 259 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00395823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03400  Ku family containing protein  34.73 
 
 		 273 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2952  Ku protein  37.02 
 
 		 274 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0023428  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0953  Ku domain-containing protein  33.46 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3417  Ku domain containing protein  35.29 
 
 		 286 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.925538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3719  Ku protein  35.19 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000216795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1814  Ku protein  38.64 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0552397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0141  Ku protein  35.71 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0124  Ku protein  36.09 
 
 		 259 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01770  Ku protein  35.22 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2607  DNA end-binding protein Ku  32.71 
 
 		 290 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36760  KU domain-containing protein  35.41 
 
 		 293 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.648282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5208  Ku protein  38.58 
 
 		 307 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.381222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3156  Ku protein  36.43 
 
 		 295 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3465  KU domain protein  33.33 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.674832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1650  Ku protein  34.22 
 
 		 274 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.475711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2656  Ku protein  35.61 
 
 		 282 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2134  Ku protein  31.75 
 
 		 274 aa  156  7e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3246  Ku  33.99 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5082  Ku  30.92 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0189  hypothetical DNA-binding protein  32.12 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1008  Ku family containing protein  36.4 
 
 		 299 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.140174  hitchhiker  0.00609843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2613  Ku  36.19 
 
 		 286 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3216  Ku domain-containing protein  35.77 
 
 		 283 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.437219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3329  Ku protein  35.23 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0181402  normal  0.3354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1728  Ku protein  32.55 
 
 		 257 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.738787  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5475  Ku protein  33.89 
 
 		 347 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0938  Ku family containing protein  36.23 
 
 		 297 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903247  normal  0.163745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3255  hypothetical protein  34.96 
 
 		 273 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0605236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2640  Ku protein  34.87 
 
 		 273 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536145  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2506  Ku family containing protein  34.96 
 
 		 273 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0900  hypothetical protein  31.09 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.116189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0045  Ku domainn containing protein  32.45 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0972  Ku protein  30.71 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1176  Ku  32.25 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.336283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0862  Ku protein  30.34 
 
 		 270 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2520  Ku domain-containing protein  33.01 
 
 		 375 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4474  Ku protein  30.34 
 
 		 270 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.232277 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2978  Ku domain-containing protein  37.17 
 
 		 307 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.180009  normal  0.23611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2329  Ku-domain-containing protein  32 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831159  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0450  hypothetical protein  30.97 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0391  Ku protein  33.78 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0706  hypothetical protein  29.21 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00186853  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2838  hypothetical protein  33.48 
 
 		 259 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0771  hypothetical protein  29.21 
 
 		 270 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.437785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0808  hypothetical protein  29.21 
 
 		 270 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.813427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0904  Ku protein  29.21 
 
 		 270 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42744e-43 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1857  Ku domain protein  32.47 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.195497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0997  Ku protein  33.93 
 
 		 264 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0497  Ku protein  34.59 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0025  Ku protein  32.95 
 
 		 301 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520285  hitchhiker  0.00000000787139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3084  Ku protein  33.03 
 
 		 284 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0154  hypothetical protein  31.84 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1347  Ku domain-containing protein  31.93 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0473966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6482  Ku domain-containing protein  31.93 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1894  Ku domain-containing protein  32.86 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.566888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3981  Ku family containing protein  35.4 
 
 		 285 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6341  Ku protein  33.09 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.198926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0719  hypothetical protein  28.89 
 
 		 270 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0188133  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4423  Ku  33.33 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1021  Ku protein  35.71 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0311227  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0502  Ku protein  30.11 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1337  Ku70/Ku80 beta-barrel domain-containing protein  31.34 
 
 		 367 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3304  Ku domain-containing protein  30.3 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418406  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0489  Ku protein  31.23 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2989  Ku protein  31.34 
 
 		 368 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0677507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>