153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5079 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  822    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  59.76 
 
 
407 aa  488  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  55.5 
 
 
406 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  55.39 
 
 
406 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  53.92 
 
 
406 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  50.12 
 
 
412 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  49.88 
 
 
412 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  46.72 
 
 
418 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  45.05 
 
 
412 aa  350  4e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  46.31 
 
 
415 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  48.18 
 
 
415 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  41.81 
 
 
416 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  43.66 
 
 
430 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  43.89 
 
 
416 aa  292  6e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  41.56 
 
 
411 aa  272  9e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  38.77 
 
 
436 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  38.42 
 
 
454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  34.13 
 
 
426 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  37.21 
 
 
415 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  33.8 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  34.24 
 
 
418 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  32.65 
 
 
406 aa  200  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  36.07 
 
 
388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  31.95 
 
 
421 aa  196  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  35.08 
 
 
409 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  32.42 
 
 
474 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  36 
 
 
385 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  34.22 
 
 
386 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  36.23 
 
 
407 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  35.07 
 
 
391 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  32.62 
 
 
394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  33.16 
 
 
389 aa  179  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  30.13 
 
 
408 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  33.54 
 
 
339 aa  177  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  30.81 
 
 
380 aa  177  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  32.03 
 
 
402 aa  173  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  29.49 
 
 
392 aa  172  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  30.89 
 
 
392 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  29.97 
 
 
412 aa  169  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  31.82 
 
 
409 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  28.81 
 
 
408 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  29.26 
 
 
385 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.3 
 
 
386 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  31.78 
 
 
388 aa  160  5e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  31.32 
 
 
384 aa  152  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  31.45 
 
 
413 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  31.12 
 
 
380 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  28.61 
 
 
426 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  36.53 
 
 
269 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  32.05 
 
 
388 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  33.16 
 
 
392 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  30.09 
 
 
383 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  32.15 
 
 
394 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  30.23 
 
 
441 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  30.69 
 
 
392 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  27.69 
 
 
376 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  30.43 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  29.14 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  28.47 
 
 
390 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2379  hypothetical protein  30.95 
 
 
408 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  28.27 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  28.5 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  27.56 
 
 
387 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  28 
 
 
376 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  29.46 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  29.88 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  32.81 
 
 
402 aa  117  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  27.91 
 
 
391 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  27.59 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  30.73 
 
 
389 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  29.37 
 
 
424 aa  112  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  25.46 
 
 
427 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  25.46 
 
 
427 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2916  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  30.75 
 
 
425 aa  106  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  29.67 
 
 
427 aa  103  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2604  AAA family ATPase  30.23 
 
 
426 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  24.4 
 
 
402 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  28.69 
 
 
402 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6614  hypothetical protein  26.23 
 
 
424 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  26.37 
 
 
382 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  27.19 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  26.37 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25.21 
 
 
379 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3053  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  28.69 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.5 
 
 
259 aa  97.1  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  27.15 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  24.79 
 
 
378 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  25.27 
 
 
419 aa  93.6  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  25.27 
 
 
398 aa  93.2  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  30.12 
 
 
350 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0030  hypothetical ATPase  23.62 
 
 
416 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  26.28 
 
 
377 aa  88.2  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1156  hypothetical protein  26.81 
 
 
423 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1402  hypothetical protein  26.95 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  25.97 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  24.87 
 
 
394 aa  83.2  0.000000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  27.23 
 
 
229 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  28.9 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.89 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  23.54 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>