78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5200 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5200  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  630  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.782608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5126  hypothetical protein  68.86 
 
 		 307 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6360  lipoprotein  68.99 
 
 		 296 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.419648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1850  periplasmic protein-like protein  38.57 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4429  hypothetical protein  43.33 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.978681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  34.52 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3927  hypothetical protein  35.48 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0108  hypothetical protein  43.18 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7625  hypothetical protein  37.5 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.359073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1411  periplasmic protein-like protein  33.33 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202803  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0116  hypothetical protein  42.86 
 
 		 212 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1949  protein of unknown function DUF1311  29.35 
 
 		 463 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0115  protein of unknown function DUF1311  42.05 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2266  hypothetical protein  37.66 
 
 		 497 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0113  hypothetical protein  40 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.357607 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4726  hypothetical protein  41.03 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3563  hypothetical protein  34.18 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0111  hypothetical protein  41.67 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0360  hypothetical protein  35.8 
 
 		 117 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5742  hypothetical protein  31.58 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.065133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4255  hypothetical protein  34.29 
 
 		 111 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0581394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0107  hypothetical protein  39.51 
 
 		 244 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0314  putative lipoprotein  39.51 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000419793  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3760  hypothetical protein  37 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.019501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0123  hypothetical protein  39.51 
 
 		 244 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0144  hypothetical protein  38.04 
 
 		 254 aa  52.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3939  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  hitchhiker  0.0000139678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3770  hypothetical protein  37.5 
 
 		 254 aa  52.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3346  hypothetical protein  38.3 
 
 		 227 aa  52.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0234924 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3795  hypothetical protein  33.08 
 
 		 240 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4023  hypothetical protein  37.63 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1150  hypothetical protein  31.71 
 
 		 122 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000576918  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1514  periplasmic protein-like protein  29.17 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0326247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4215  hypothetical protein  39.13 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4262  hypothetical protein  31.4 
 
 		 479 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109505  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3068  hypothetical protein  33.08 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1387  hypothetical protein  34.78 
 
 		 132 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122342  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0822  hypothetical protein  30.59 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38987  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4006  hypothetical protein  38.2 
 
 		 211 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49960  hypothetical protein  34.57 
 
 		 111 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3205  hypothetical protein  30.88 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.87511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3702  hypothetical protein  36.47 
 
 		 206 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1321  hypothetical protein  37.93 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.113057  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6080  hypothetical protein  32.93 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5702  hypothetical protein  31.25 
 
 		 100 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.667293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  31.25 
 
 		 446 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2090  hypothetical protein  38.82 
 
 		 356 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4134  hypothetical protein  37.18 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000233286  normal  0.28167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11574  lipoprotein lprI  35.8 
 
 		 197 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2536  hypothetical protein  31.08 
 
 		 231 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0501  hypothetical protein  32.18 
 
 		 196 aa  46.6  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5697  hypothetical protein  31.33 
 
 		 123 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1414  hypothetical protein  29.87 
 
 		 245 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0757  putative lipoprotein  36.47 
 
 		 280 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7075  lipoprotein-like protein  29.87 
 
 		 245 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446576 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6415  hypothetical protein  29.87 
 
 		 245 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1128  hypothetical protein  34.88 
 
 		 462 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1838  hypothetical protein  32.91 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3898  hypothetical protein  29.23 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22860  lipoprotein  34.88 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4296  hypothetical protein  32.53 
 
 		 119 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  decreased coverage  0.00880745 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2133  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.5 
 
 		 436 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0279976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2425  hypothetical protein  31.97 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524808  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1492  hypothetical protein  31.11 
 
 		 222 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176688  normal  0.453019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2072  hypothetical protein  40 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.357327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2194  hypothetical protein  28.46 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.988772  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3785  hypothetical protein  32.89 
 
 		 570 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0009  hypothetical protein  29.89 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0877665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1865  hypothetical protein  30.38 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1310  hypothetical protein  31.63 
 
 		 230 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0141976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4591  hypothetical protein  29.76 
 
 		 166 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1104  hypothetical protein  27.13 
 
 		 268 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720924  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3251  hypothetical protein  27.95 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07118  hypothetical protein  32.58 
 
 		 197 aa  42.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3275  hypothetical protein  28.19 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2634  hypothetical protein  31.76 
 
 		 192 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579802  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2752  hypothetical protein  31.76 
 
 		 193 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>