231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4195 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 318 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  48.05 
 
 		 307 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  34.41 
 
 		 290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  34.05 
 
 		 297 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  31.83 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 304 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  31.97 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  30.36 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  31.63 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  30.61 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  31.76 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  32.57 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 		 295 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  26.19 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5684  Chitin deacetylase  27.4 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260048  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  25.76 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  25.08 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  29.12 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  26.09 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  28.37 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  25.77 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  27.74 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0499  putative polysaccharide deacetylase family protein  26.71 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  25.34 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6198  urate catabolism protein  26.87 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1919  polysaccharide deacetylase  25.08 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  25.34 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  27.4 
 
 		 470 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4388  polysaccharide deacetylase  25.5 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.677693  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  27.37 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  27.37 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  27.37 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  27.37 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  27.01 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  27.37 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  27.37 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  27.01 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 471 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  26.71 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2120  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  24.66 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  26.71 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  24.22 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  25.43 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  27.3 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0869  urate catabolism protein  26.19 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1111  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2605  polysaccharide deacetylase family protein  27.21 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30682  predicted protein  23.39 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673385  normal  0.0672265 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 470 aa  79  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0901  urate catabolism protein  26.53 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  28.47 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  26.21 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  24.79 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  28.47 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2260  urate catabolism protein  24.58 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0671776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  27.37 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0659  urate catabolism protein  26.09 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2437  polysaccharide deacetylase  23 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1937  urate catabolism protein  23.91 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39074  normal  0.0426903 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  26.71 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  26.28 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  25.17 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  23.32 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  25.09 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  28.1 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03354  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B3VP82]  26.44 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09327  conserved hypothetical protein  21.48 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0916  chitin deacetylase  25 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0882  polysaccharide deacetylase  23.57 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  25 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1111  urate catabolism protein  25.08 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.808218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  24.28 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1058  polysaccharide deacetylase family protein  25.08 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  26.22 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  26.26 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  25.26 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  24.16 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  23.89 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>