More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4009 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  83.13 
 
 		 250 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  72.65 
 
 		 257 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  72.36 
 
 		 257 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  72.65 
 
 		 257 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  60.57 
 
 		 253 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  55.33 
 
 		 261 aa  262  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  53.41 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  53.82 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  52.61 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  52.02 
 
 		 253 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  52 
 
 		 263 aa  251  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  51.23 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  51.81 
 
 		 265 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  50.61 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  48.41 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  44.49 
 
 		 254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2273  ABC transporter related  45.71 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.639311  normal  0.805195 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.26 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  45.12 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  46.12 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  42.86 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  43.09 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  44.13 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  42.62 
 
 		 249 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  41.87 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  45.04 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0651  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.824506  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0613  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.56 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  48.37 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  41.3 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3733  ABC transporter related  44.35 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.157597  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  45.27 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  43.15 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  41.77 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  42.28 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  41.63 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  44.26 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  42.62 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  42.74 
 
 		 249 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  42.11 
 
 		 842 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  45.27 
 
 		 852 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  43.15 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0854  ABC transporter related  40.64 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.690377  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  42.56 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  44.26 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  41.56 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2552  ABC transporter related  42.57 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  41.49 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41.8 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  41.39 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  41.39 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  42.8 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  41.8 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  45.2 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  39.02 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  39.02 
 
 		 251 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  40.74 
 
 		 258 aa  184  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.41 
 
 		 264 aa  184  9e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  40.89 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  39.02 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  39.92 
 
 		 245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  43.62 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  44 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2418  ABC transporter related  41.67 
 
 		 255 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.02 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  41.94 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  42.45 
 
 		 271 aa  182  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  42.34 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  44.62 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  41.98 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.6 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  43.62 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  39.6 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6214  ABC transporter related  44.21 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  43.78 
 
 		 245 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  41.37 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  43.62 
 
 		 233 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  41.77 
 
 		 859 aa  181  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  41.83 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.62 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  40.82 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  40.8 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>