More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3747 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  362  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  55.06 
 
 		 192 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  55.06 
 
 		 192 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 193 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  54.34 
 
 		 198 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 174 aa  165  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2923  MarR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4788  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 124 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.421103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 153 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  32.28 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0676  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  28.83 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  31.15 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  29.31 
 
 		 138 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  30.83 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35.48 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  27.21 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  28.06 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  28.28 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  26.5 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  26.5 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  28.15 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 150 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 150 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 154 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 153 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 149 aa  51.2  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 141 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  25.85 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 157 aa  51.2  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  26.26 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>