More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1734 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  523  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.53 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414086  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 224 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4084  two component LuxR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  36.36 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 223 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.0443917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1772  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3515  two component LuxR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150532  hitchhiker  0.00248481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 228 aa  99.4  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0373  response regulator receiver  31.82 
 
 		 220 aa  99.4  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.84 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3952  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 212 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.78 
 
 		 213 aa  95.9  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  30.27 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3380  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.71 
 
 		 224 aa  95.9  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 215 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 221 aa  95.5  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30.81 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30.81 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  30.24 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30.81 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3237  response regulator  35.06 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2941  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.52 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.08 
 
 		 207 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.09 
 
 		 262 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  32.88 
 
 		 213 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.781509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 217 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 216 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.26 
 
 		 219 aa  92.8  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0377  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  36.42 
 
 		 206 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.15 
 
 		 210 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 208 aa  92  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 227 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  35.75 
 
 		 218 aa  92  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.84 
 
 		 217 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 222 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 216 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 		 209 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.8 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  31.86 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.14 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.97 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  36.22 
 
 		 206 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.79 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18530  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.91 
 
 		 209 aa  90.5  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.2 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1851  two component LuxR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467917  normal  0.53175 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.98 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 215 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.46 
 
 		 226 aa  89.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.8 
 
 		 212 aa  89  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 233 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0919  two component LuxR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 214 aa  89  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 219 aa  89  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 219 aa  89  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 225 aa  89  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.28 
 
 		 226 aa  89  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3480  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.84 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2623  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.84 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>