More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0519 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  293  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0458  hypothetical protein  79.31 
 
 		 144 aa  238  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5174  hypothetical protein  58.62 
 
 		 147 aa  180  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  60.84 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1165  hypothetical protein  59.03 
 
 		 146 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  60.14 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  34.53 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2543  UspA domain protein  36.69 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431262  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  32.62 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  32.87 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  32.64 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1627  UspA domain-containing protein  36.69 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  33.09 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  37.86 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1741  hypothetical protein  33.57 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.447862  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4309  hypothetical protein  33.57 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00391503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  27.86 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.34 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  38.3 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  34.97 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.34 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  33.33 
 
 		 297 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.41 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  32.89 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.23 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  33.79 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.59 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  31.47 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  29.08 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  30.94 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.67 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  57.14 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  35.92 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  27.27 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  35.17 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  52 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  35.04 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  43.86 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  28.38 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  27.86 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  32.94 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  30.56 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  28.19 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  32.17 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32.14 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.28 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.19 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  27.33 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  39.51 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  27.14 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  30.07 
 
 		 280 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.5 
 
 		 207 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  52.08 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  27.74 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  26.53 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  31.46 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  32.19 
 
 		 297 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  31.53 
 
 		 323 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  35.8 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  25.71 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  33.33 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  30.56 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 		 151 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.8 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  28.97 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  34.07 
 
 		 317 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  26.62 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.67 
 
 		 320 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  33.78 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  26.76 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  29.41 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  32.14 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  36.54 
 
 		 303 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  32.19 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  28.57 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  31.91 
 
 		 282 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>