More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0052 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0052  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0022  AraC family transcriptional regulator  82.49 
 
 		 272 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2365  AraC family transcriptional regulator  53.63 
 
 		 257 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5828  AraC family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243558  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1967  AraC family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 257 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.397797  normal  0.0346972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1602  transcriptional regulator, AraC family  51.97 
 
 		 265 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6884  AraC family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1548  AraC family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 266 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6281  AraC family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 266 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  0.898598 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6773  AraC family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48310  putative transcriptional regulator  49.79 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.141935  normal  0.137096 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2930  AraC family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4834  AraC family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3166  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 254 aa  225  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4289  AraC family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 277 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.364848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3190  AraC family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4970  AraC family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0140  AraC family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 256 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4726  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 262 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5182  AraC family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 241 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02030  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 265 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0243  putative transcriptional regulator  44.08 
 
 		 265 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0719  AraC family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4301  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3814  helix-turn-helix domain-containing protein  39.53 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.777055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3256  AraC family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 262 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.673887  normal  0.287116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3734  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.0342105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4464  AraC family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 263 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5292  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 310 aa  198  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2671  AraC family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1876  AraC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.974841  normal  0.0151551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2116  AraC family transcriptional regulator  41 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0399  AraC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 253 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2711  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1180  putative transcriptional regulator  42.44 
 
 		 262 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2259  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0423097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1892  transcriptional regulator, AraC family  41.3 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1502  AraC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.244306 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4169  AraC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 283 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961188  normal  0.0248126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3347  AraC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 283 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0172  AraC family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2200  AraC family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13060  putative transcriptional regulator  42.02 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0650  AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4057  AraC family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 303 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.681219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2631  AraC family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 291 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.706027  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 283 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3576  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0189219  normal  0.239168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  42.34 
 
 		 273 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  39.11 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3252  transcriptional regulator, AraC family  40.65 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2490  AraC family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 247 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0596  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 284 aa  185  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14480  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1654  transcriptional regulator, AraC family  44.54 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0592453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4313  transcriptional regulator, AraC family  40.08 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1291  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  40.33 
 
 		 267 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4116  AraC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4278  AraC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3674  transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 		 273 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.222565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5145  transcriptional regulator, AraC family  42.15 
 
 		 248 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2252  transcriptional regulator, AraC family  41.89 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1951  AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4421  putative HTH-type transcriptional regulator YeaM  39.64 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2424  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1462  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02220  Transcriptional regulator, AraC-family  37.55 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0628  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458217  hitchhiker  0.000431435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1993  AraC family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0622  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0657  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0583  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4581  AraC family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0126281 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0740  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.218916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0159  AraC family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2994  transcriptional regulator, AraC family  42.15 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5716  AraC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205456 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1893  putative transcriptional regulator  36.07 
 
 		 258 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000476135 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3341  transcriptional regulator, AraC family  41.7 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.811719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2335  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0808  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.274557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3244  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.515749  normal  0.506544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4919  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5836  transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3062  transcription regulator protein  39.75 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0885  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0430739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3997  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.415557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6500  AraC family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  39.02 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>