More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3496 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  87.55 
 
 		 233 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 227 aa  314  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1700  GntR-like protein  44.17 
 
 		 164 aa  141  8e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000000597096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  37.95 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 241 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8629  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  36.89 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 230 aa  99  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 257 aa  98.2  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  32.06 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 267 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 251 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 221 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 233 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 293 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  31.42 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>