More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1700 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1700  GntR-like protein  100 
 
 		 164 aa  336  8e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000000597096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 227 aa  158  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 237 aa  141  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  42.33 
 
 		 233 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  35.22 
 
 		 229 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 229 aa  73.9  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.8 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 231 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  29.27 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1907  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.128765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2185  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  30.2 
 
 		 224 aa  67  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 233 aa  67  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 255 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1746  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 255 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 241 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 218 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 222 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  27.33 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  29.48 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.54 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 223 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 242 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 245 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  27.74 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5559  transcriptional regulator GntR family  29.01 
 
 		 252 aa  60.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 229 aa  60.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 262 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 262 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3025  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.131059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3215  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0184388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  30.3 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6553  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4345  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3241  transcriptional regulator, GntR family  26.71 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  29.65 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  27.95 
 
 		 239 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 		 237 aa  57.4  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 232 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 253 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>