86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2244 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  257  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  99.21 
 
 		 126 aa  254  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  51.59 
 
 		 129 aa  144  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  51.54 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2579  hypothetical protein  55.14 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164818  hitchhiker  0.0000131473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1885  hypothetical protein  42.48 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  33.83 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2293  hypothetical protein  35.29 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.401413  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2925  hypothetical protein  44.29 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  37.84 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  41.38 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  38.98 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  33.85 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  39.62 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  35.19 
 
 		 300 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2045  hypothetical protein  30.33 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000649119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0802  hypothetical protein  32.59 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0773  hypothetical protein  32.59 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  32.5 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  33.9 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  34.19 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2348  hypothetical protein  30.25 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0044587  normal  0.12672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  33.07 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  30.6 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  32.37 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  34.91 
 
 		 272 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  28 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  32.12 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3740  hypothetical protein  32.2 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00447243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  29.08 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09958  hypothetical protein  28.87 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4104  hypothetical protein  30.77 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  33.09 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  35.24 
 
 		 262 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  32.12 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  24.49 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  32 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0322  hypothetical protein  33.58 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  29.27 
 
 		 231 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4374  hypothetical protein  30.56 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01791  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  29.66 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3041  conserved hypothetical signal peptide protein  28.81 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2631  putative signal peptide protein  28.81 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  0.77547 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1338  hypothetical protein  30.83 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  28.03 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  28.29 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  30.58 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0103  hypothetical protein  43.06 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0811  hypothetical protein  29.66 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0593  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1419  hypothetical protein  25.93 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.874564  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0572  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2807  putative signal peptide protein  32.14 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  28.81 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6081  hypothetical protein  43.06 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  28 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1645  putative signal peptide protein  30.71 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.399726 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0965  hypothetical protein  27.56 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996069  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0550  hypothetical protein  30.61 
 
 		 148 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000170844 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1046  hypothetical protein  30.99 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.29497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1493  hypothetical protein  30.99 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0161  hypothetical protein  30.99 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1005  hypothetical protein  30.99 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.660844  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  30 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  27.54 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  28.37 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0663  hypothetical protein  29.63 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1033  hypothetical protein  31.69 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2647  hypothetical protein  31.9 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.694263  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29440  hypothetical protein  32.87 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4654  hypothetical protein  30.71 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388163  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1034  hypothetical protein  32.06 
 
 		 168 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2551  putative lipoprotein  31.75 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1118  hypothetical protein  27.56 
 
 		 112 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  31.3 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3426  hypothetical protein  28.28 
 
 		 178 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  31.91 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5549  hypothetical protein  32 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.355042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1716  putative signal peptide protein  32.28 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2798  putative signal peptide protein  37.88 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00624822  normal  0.61981 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1742  hypothetical protein  33.85 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050816 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3048  hypothetical protein  26.43 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.904899  normal  0.0139913 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1435  hypothetical protein  31.51 
 
 		 153 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152926  normal  0.0416375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>