More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1937 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  81.51 
 
 		 468 aa  787    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  90.73 
 
 		 468 aa  807    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  83.76 
 
 		 468 aa  799    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  949    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  81.94 
 
 		 468 aa  794    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  78.97 
 
 		 467 aa  756    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  89.68 
 
 		 468 aa  836    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  62.07 
 
 		 460 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  61.11 
 
 		 471 aa  586  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  61.11 
 
 		 471 aa  586  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  60.78 
 
 		 460 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  59.91 
 
 		 469 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  60.04 
 
 		 461 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  60.13 
 
 		 461 aa  564  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  58.7 
 
 		 462 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  58.26 
 
 		 462 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  59.91 
 
 		 462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  58.1 
 
 		 468 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  58.91 
 
 		 462 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  59.48 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  58.39 
 
 		 463 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  57.61 
 
 		 471 aa  551  1e-155  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  59.48 
 
 		 461 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  59.26 
 
 		 461 aa  544  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  56.34 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  59.31 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  59.83 
 
 		 457 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  56.09 
 
 		 468 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  58.08 
 
 		 460 aa  526  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  59.26 
 
 		 457 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  54.55 
 
 		 465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  53.59 
 
 		 458 aa  505  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  55.68 
 
 		 464 aa  501  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  56.1 
 
 		 488 aa  501  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  54.31 
 
 		 461 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  51.09 
 
 		 484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  51.39 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  49.46 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  44.13 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  43.08 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  43.51 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  43.91 
 
 		 453 aa  346  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  43.95 
 
 		 458 aa  345  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  42.61 
 
 		 456 aa  334  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  43.57 
 
 		 456 aa  331  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  41.91 
 
 		 453 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  42.4 
 
 		 463 aa  329  6e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  41.94 
 
 		 460 aa  329  7e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  40.99 
 
 		 456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  43.15 
 
 		 459 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  42.92 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  40.63 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  38.26 
 
 		 463 aa  309  5.9999999999999995e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  40.54 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  41.02 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  41.58 
 
 		 485 aa  302  8.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  38.24 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  40 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  37.94 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.42 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  40.04 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.31 
 
 		 475 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  38.08 
 
 		 455 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  40.55 
 
 		 465 aa  286  5.999999999999999e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  39.91 
 
 		 467 aa  286  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  37.93 
 
 		 474 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  39.87 
 
 		 481 aa  279  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  38.43 
 
 		 458 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  37.41 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  37.95 
 
 		 456 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  37.58 
 
 		 472 aa  262  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  38.2 
 
 		 464 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  37.27 
 
 		 479 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  33.89 
 
 		 496 aa  223  7e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  30.19 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  34.51 
 
 		 467 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  32.67 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  34.44 
 
 		 465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  34 
 
 		 465 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  34 
 
 		 465 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  32.35 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  29.85 
 
 		 476 aa  195  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  31.32 
 
 		 445 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  30.75 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  30.75 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  31 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  30.75 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  34.6 
 
 		 484 aa  190  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  31.97 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  29.6 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  31.13 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  31.91 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  28.93 
 
 		 535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  31.47 
 
 		 453 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  36.21 
 
 		 406 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  30.11 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  32.63 
 
 		 460 aa  179  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  31.62 
 
 		 460 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  31.64 
 
 		 418 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  30.55 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>