More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3528 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2229  hypothetical protein  78.97 
 
 		 468 aa  762    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0165936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3528  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  951    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1769  hypothetical protein  83.26 
 
 		 468 aa  781    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.547863  normal  0.297854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1937  hypothetical protein  90.73 
 
 		 468 aa  850    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.293644  normal  0.311555 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2629  hypothetical protein  79.83 
 
 		 468 aa  768    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3030  hypothetical protein  79.18 
 
 		 467 aa  751    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2048  hypothetical protein  88.84 
 
 		 468 aa  832    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2668  hypothetical protein  64.1 
 
 		 460 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.182332  normal  0.293483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2921  hypothetical protein  63 
 
 		 460 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0121  hypothetical protein  62.47 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0118  hypothetical protein  62.47 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0136  hypothetical protein  61.24 
 
 		 469 aa  594  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4100  hypothetical protein  60.83 
 
 		 462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1655  hypothetical protein  60.48 
 
 		 461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645191  normal  0.0257012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4420  hypothetical protein  60.43 
 
 		 462 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.33388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0757  hypothetical protein  61.95 
 
 		 461 aa  569  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0772508  normal  0.110286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4483  hypothetical protein  61.54 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.47987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  60.71 
 
 		 463 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0301  hypothetical protein  61.01 
 
 		 462 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3983  hypothetical protein  60.57 
 
 		 462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0794  hypothetical protein  61.73 
 
 		 461 aa  557  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0834  hypothetical protein  61.5 
 
 		 461 aa  554  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1220  hypothetical protein  58.86 
 
 		 471 aa  554  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349749  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5344  hypothetical protein  58.42 
 
 		 468 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3239  hypothetical protein  57.54 
 
 		 470 aa  539  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  57.61 
 
 		 468 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0367  hypothetical protein  58.73 
 
 		 460 aa  534  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1645  hypothetical protein  55.41 
 
 		 465 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1865  hypothetical protein  60.31 
 
 		 457 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2986  hypothetical protein  59.51 
 
 		 470 aa  521  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239395  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1632  hypothetical protein  59.29 
 
 		 457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0287575  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1931  hypothetical protein  54.17 
 
 		 458 aa  512  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2039  hypothetical protein  56.71 
 
 		 488 aa  511  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1823  hypothetical protein  54.43 
 
 		 461 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00111141  normal  0.415659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  54.97 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4952  hypothetical protein  49.89 
 
 		 484 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0769  hypothetical protein  51.18 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0859  hypothetical protein  50 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  45.2 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  45.43 
 
 		 455 aa  358  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5953  peptidase M20  44.6 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2077  peptidase M20  43.31 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  44.22 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  43.31 
 
 		 463 aa  339  7e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3741  peptidase M20  43.38 
 
 		 453 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0843  peptidase M20  43.02 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1407  peptidase M20  43.33 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  43.18 
 
 		 459 aa  330  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  41.91 
 
 		 456 aa  330  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1438  peptidase M20  42.3 
 
 		 456 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1849  peptidase M20  40.91 
 
 		 459 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1548  peptidase M20  40.14 
 
 		 465 aa  316  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  41.61 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04975  putative peptidase  43.31 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0813  peptidase M20  37.66 
 
 		 463 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206075  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0401  hypothetical protein  41.61 
 
 		 460 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0950  peptidase M20  40.81 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.404895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2377  hypothetical protein  37.81 
 
 		 462 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00727448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1419  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.6 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0033169  normal  0.0160825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1696  peptidase dimerisation domain-containing protein  38.5 
 
 		 456 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151235  hitchhiker  0.00152068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3184  peptidase M20  39.7 
 
 		 457 aa  300  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  38.65 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  38.7 
 
 		 455 aa  296  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1759  peptidase M20  40.55 
 
 		 465 aa  292  8e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4241  Beta-Ala-His dipeptidase  40.78 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1773  peptidase M20  39.46 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.15054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  38.26 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3811  Beta-Ala-His dipeptidase  38.17 
 
 		 458 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000599771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7804  peptidase M20  38 
 
 		 472 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  36.16 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  37.78 
 
 		 456 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0526  putative peptidase  38.43 
 
 		 464 aa  260  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0848  peptidase M20  35.83 
 
 		 479 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3933  peptidase M20  34.86 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0993  peptidase M20  30.8 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0767471  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0863  peptidase M20  35.53 
 
 		 465 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0920  peptidase M20  34.25 
 
 		 467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0912  peptidase M20  34.89 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0908  peptidase M20  34.89 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.376203  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  33.26 
 
 		 451 aa  206  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  33.26 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4319  hypothetical protein  32.51 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.899733  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01640  glutamate carboxypeptidase protein, putative  30.3 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182836  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  32.55 
 
 		 453 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  30.45 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03459  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05450)  30.66 
 
 		 535 aa  190  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00014033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1460  peptidase M20  32.6 
 
 		 445 aa  189  9e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.501063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1840  peptidase M20  32.7 
 
 		 448 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3658  hypothetical protein  30.65 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0188215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3645  hypothetical protein  30.65 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3718  hypothetical protein  30.65 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.311762  normal  0.817025 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  31.58 
 
 		 453 aa  186  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1956  peptidase M20  31.7 
 
 		 484 aa  183  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000066286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2549  peptidase M20  31.48 
 
 		 448 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.549229  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4122  hypothetical protein  31.41 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.498237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3551  hypothetical protein  31.65 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2156  hypothetical protein  32.6 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366159  normal  0.0201539 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  33.33 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3262  peptidase M20  32.54 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2228  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.03 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>