More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2430 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 132 aa  273  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  86.07 
 
 		 128 aa  223  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  49.58 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 140 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 		 185 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  45.3 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 185 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 185 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  47.41 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  50.52 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  40.83 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  48.45 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  42.98 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  44.33 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 165 aa  86.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  48.19 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  38.89 
 
 		 758 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  37.07 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 154 aa  57  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  50.94 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  32.98 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  36 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  36.45 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  33.64 
 
 		 306 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  27.66 
 
 		 435 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  35.34 
 
 		 313 aa  52.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 398 aa  52  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.27 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4522  MutT family pyrophosphohydrolase  38.37 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.986145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4908  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  38.37 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0330  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  38.37 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3459  nucleoside triphosphatase YtkD  38.37 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.160983  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 		 226 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4928  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  38.37 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.61 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.61 
 
 		 178 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  44.62 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4620  nucleoside triphosphatase YtkD  44.62 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4683  mutT/nudix family protein  44.62 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4541  MutT/NUDIX family pyrophosphohydrolase  44.62 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  30.56 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5043  mutT/nudix family protein  44.62 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.37 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 314 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  31.93 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.37 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  31.93 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4907  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  44.62 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.37 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  54.17 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  45.28 
 
 		 347 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  45 
 
 		 168 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>