More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4033 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  100 
 
 		 183 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  99.45 
 
 		 202 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  98.35 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  87.43 
 
 		 176 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  72.53 
 
 		 186 aa  276  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  70.88 
 
 		 184 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  69.23 
 
 		 183 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  70.73 
 
 		 184 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  70.73 
 
 		 184 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  70.55 
 
 		 183 aa  240  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  48.85 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  48.85 
 
 		 203 aa  181  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  48.6 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  48.85 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  48.04 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  48.04 
 
 		 230 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  48.04 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  51.53 
 
 		 208 aa  177  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  47.49 
 
 		 179 aa  177  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  48.82 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  49.13 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 180 aa  171  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  51.92 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  51.46 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  46.82 
 
 		 182 aa  164  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  45.4 
 
 		 192 aa  164  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  47.56 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  46.24 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  47.17 
 
 		 202 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  46.01 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  45.61 
 
 		 231 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 231 aa  151  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  44.57 
 
 		 189 aa  151  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  44.57 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  42.77 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  45.75 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  44.31 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  49.02 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  45.25 
 
 		 192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  44.3 
 
 		 233 aa  141  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  41.18 
 
 		 191 aa  136  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  41.44 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  40.12 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  50.74 
 
 		 195 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  42.77 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  48.18 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  42.95 
 
 		 161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  40.76 
 
 		 191 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  40.82 
 
 		 158 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  44.53 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  43.57 
 
 		 158 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  42.07 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  40.14 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0007  glutathione peroxidase  44.12 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  43.7 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  41.01 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  41.83 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  42.47 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  46.62 
 
 		 182 aa  118  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  43.26 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0888  glutathione peroxidase  44.53 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.919035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  42.07 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  43.24 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  45.38 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  43.24 
 
 		 159 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  40.38 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  43.66 
 
 		 159 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  42.48 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  47.58 
 
 		 157 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  42.48 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  38.8 
 
 		 195 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  38.29 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  40.97 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  42.48 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  44.12 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  44.53 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  41.78 
 
 		 160 aa  115  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  42.95 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  41.72 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  37.93 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  43.48 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  40.52 
 
 		 158 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  43.97 
 
 		 158 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  39.88 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  43.57 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  42.86 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  45.32 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>