More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4353 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  100 
 
 		 620 aa  1279    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0783  peptidase S14 ClpP  45.48 
 
 		 669 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.364039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0787  peptidase S14 ClpP  45.47 
 
 		 668 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0494258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3598  peptidase S14 ClpP  45.47 
 
 		 640 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3202  Clp protease domain protein  43.86 
 
 		 651 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.790281  hitchhiker  0.00227439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1864  Clp protease domain protein  43.86 
 
 		 651 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  43.86 
 
 		 1156 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0756  peptidase S14 ClpP  44.77 
 
 		 671 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0900  Clp protease domain protein  44.64 
 
 		 652 aa  478  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0695  ATP-dependent protease  41.56 
 
 		 689 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.265261  hitchhiker  0.00014029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1071  ATP-dependent protease  41.52 
 
 		 684 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.146018  hitchhiker  0.00123703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1143  ATP-dependent protease  41.96 
 
 		 683 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1408  ATP-dependent protease  41.52 
 
 		 684 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104115  hitchhiker  0.000644227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3249  peptidase S14, ClpP  41.05 
 
 		 667 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1678  peptidase S14, ClpP  40.84 
 
 		 656 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2253  peptidase S14, ClpP  40.06 
 
 		 674 aa  395  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0288659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6597  putative peptidase S14, ClpP  45.36 
 
 		 684 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0961  peptidase S14, ClpP  33.82 
 
 		 641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.019957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2190  peptidase S14, ClpP  30.69 
 
 		 688 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000592191 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  36.57 
 
 		 687 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  34.87 
 
 		 600 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  36.05 
 
 		 696 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  35.57 
 
 		 689 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  29.31 
 
 		 624 aa  169  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  33.54 
 
 		 586 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  32.09 
 
 		 693 aa  153  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  30.84 
 
 		 599 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7330  peptidase S14 ClpP  46.71 
 
 		 237 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.307077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3971  peptidase S14, ClpP  46.27 
 
 		 216 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269828 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2017  peptidase S14, ClpP  31.19 
 
 		 391 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0643  peptidase S14, ClpP  43.97 
 
 		 282 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1874  peptidase S14, ClpP  39.25 
 
 		 361 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0399  ClpP protease family protein  38.15 
 
 		 229 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2835  peptidase S14 ClpP  38.15 
 
 		 229 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1633  peptidase S14 ClpP  37.35 
 
 		 287 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0361  peptidase S14, ClpP  35.71 
 
 		 280 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0990  peptidase S14, ClpP  35.71 
 
 		 280 aa  121  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2501  peptidase S14 ClpP  40.13 
 
 		 280 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3866  peptidase S14 ClpP  41.4 
 
 		 280 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220297 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1046  ClpP protease  37.7 
 
 		 280 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2473  peptidase S14 ClpP  35 
 
 		 227 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1086  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP, putative  41.78 
 
 		 242 aa  113  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4252  peptidase S14 ClpP  37.58 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1720  peptidase S14, ClpP  44 
 
 		 247 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2239  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.69 
 
 		 251 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00816781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3804  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.69 
 
 		 251 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0626  peptidase S14 ClpP  36.52 
 
 		 244 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4092  prophage LambdaBa02, Clp protease family protein  37.69 
 
 		 251 aa  110  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  28.38 
 
 		 612 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1115  peptidase S14, ClpP  34.76 
 
 		 243 aa  108  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2389  peptidase S14, ClpP  41.94 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.142476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2853  peptidase S14 ClpP  41.84 
 
 		 564 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12086  normal  0.0147966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2605  peptidase S14, ClpP  31.87 
 
 		 258 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1253  peptidase S14, ClpP  41.38 
 
 		 226 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1629  peptidase S14, ClpP  41.96 
 
 		 242 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4920  peptidase S14 ClpP  43.62 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.558143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3409  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  36.31 
 
 		 381 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.702089  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0586  Clp protease  34.64 
 
 		 247 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1543  peptidase S14, ClpP  40.85 
 
 		 281 aa  104  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6185  ClpP-type protease  41.36 
 
 		 284 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2895  hypothetical protein  30.39 
 
 		 780 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294746  normal  0.115998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3045  ClpP protease, putative  35.12 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0206351  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1061  peptidase S14, ClpP  36.92 
 
 		 257 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1081  peptidase S14 ClpP  36.92 
 
 		 257 aa  100  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.631599  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2068  putative ClpP-like protease  39.58 
 
 		 279 aa  98.2  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.254217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2623  Clp protease  37.4 
 
 		 197 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3317  peptidase S14, ClpP  39.58 
 
 		 279 aa  97.4  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.13528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4104  hypothetical protein  28.43 
 
 		 780 aa  96.3  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.241188  hitchhiker  0.00000455775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4003  Clp protease  34.71 
 
 		 230 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2964  ClpP protease family protein  40.16 
 
 		 284 aa  94  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3590  peptidase S14 ClpP  37.06 
 
 		 247 aa  94  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0660  Clp protease  36.36 
 
 		 248 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2593  peptidase S14 ClpP  35.9 
 
 		 284 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.315454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1198  peptidase S14 ClpP  29.71 
 
 		 383 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124862 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2700  phage protein  33.33 
 
 		 260 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.946322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4464  ClpP protease  29.65 
 
 		 282 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000555404 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1378  Clp protease  35.66 
 
 		 247 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455608 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  27.83 
 
 		 623 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03500  peptidase S14 ClpP  30.43 
 
 		 234 aa  88.6  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  25.95 
 
 		 1179 aa  87  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1646  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  30.94 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5772  peptidase S14 ClpP  42.19 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  35.16 
 
 		 345 aa  83.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0013  putative endopeptidase  32.05 
 
 		 243 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2057  peptidase S14 ClpP  38.4 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2021  peptidase S14, ClpP  38.4 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1484  protease subunit of ATP-dependent Clp protease  35.66 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1304  peptidase S14 ClpP  35.46 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2696  hypothetical protein  26.74 
 
 		 770 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28390  protease subunit of ATP-dependent protease  35.11 
 
 		 197 aa  72.8  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  34.62 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1205  peptidase S14, ClpP  30.22 
 
 		 300 aa  67  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0522889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.08 
 
 		 198 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  33.85 
 
 		 225 aa  66.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  31.29 
 
 		 221 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17821  Clp protease proteolytic subunit  34.59 
 
 		 200 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  33.08 
 
 		 210 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18461  Clp protease proteolytic subunit  32.59 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1785  hypothetical protein  26.44 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.78 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>