287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1465 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  55.83 
 
 		 245 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  56.56 
 
 		 251 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  55.45 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  51.33 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  52 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  37.83 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  36.67 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.44 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  35.34 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  36.52 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  36.52 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  36.52 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  36.52 
 
 		 246 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.52 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  33.75 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  36.65 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  35.94 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  35.17 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  38.18 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  36.02 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  37 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  38.16 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  35.68 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  38.86 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.68 
 
 		 247 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.68 
 
 		 247 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.5 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  35.37 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  36.96 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  33.89 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.48 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  39.17 
 
 		 248 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  34.82 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  36.17 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.4 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.47 
 
 		 244 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  32.78 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.32 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  35.78 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  35.32 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.53 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.32 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  31.93 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  32.88 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  32.74 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  31.05 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  35.32 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  35.32 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  34.45 
 
 		 227 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  35.32 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  31.91 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  31.91 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  33.49 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  33.49 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.63 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  33.01 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.26 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  31.91 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  32.27 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  32.44 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  33.49 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  35.02 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  33.65 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  35.35 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  32.3 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  35.35 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  33.04 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  33.05 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  33.05 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  35.35 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  32.48 
 
 		 309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  33.05 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  34.6 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.39 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  29.52 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  33.19 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  35.39 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  31.94 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.33 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  34.6 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  34.6 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  31.82 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  31.33 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  34.6 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  34.6 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  31.82 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  31.33 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  31.33 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  31.33 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  32.75 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  30.9 
 
 		 231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  29.71 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  32.02 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  32.02 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  32.02 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  35.02 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  35.02 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  31 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  29.39 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>