206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2195 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  280  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  58.78 
 
 
138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  60.8 
 
 
140 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  60 
 
 
140 aa  153  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  55.47 
 
 
131 aa  149  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  56.06 
 
 
332 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  55.12 
 
 
385 aa  139  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  52.8 
 
 
332 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  45 
 
 
324 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  45.08 
 
 
131 aa  115  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  44.44 
 
 
144 aa  114  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  42.52 
 
 
323 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  45.16 
 
 
151 aa  103  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  42.98 
 
 
141 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  45.6 
 
 
143 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  45.6 
 
 
143 aa  101  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  38.89 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  43.41 
 
 
205 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  40.91 
 
 
151 aa  92  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  33.08 
 
 
127 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  38.89 
 
 
265 aa  92  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  41.27 
 
 
272 aa  91.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  38.52 
 
 
167 aa  91.3  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  37.98 
 
 
145 aa  90.9  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  31.58 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  40.8 
 
 
311 aa  89.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  36.36 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  41.27 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  42.5 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  40.6 
 
 
183 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  31.3 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  37.04 
 
 
171 aa  85.5  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  35.94 
 
 
271 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  38.93 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  37.01 
 
 
166 aa  84.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  41.86 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  39.34 
 
 
162 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  35.25 
 
 
168 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  83.6  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  37 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  42.75 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  36.76 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  35.61 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  38.52 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  39.1 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  34.59 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  40.5 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  35.25 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  42.99 
 
 
294 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  35.25 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  36.67 
 
 
162 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  34.65 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  37.7 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  35.16 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  36.57 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  34.81 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  35.66 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 
163 aa  80.1  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  38.33 
 
 
164 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  40.3 
 
 
241 aa  80.1  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  34.65 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  37.1 
 
 
165 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  32.8 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  36.36 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  35.46 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  43.16 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  36.67 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  40.83 
 
 
182 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  38.4 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  37.31 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  35.61 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  37.59 
 
 
155 aa  77  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  42.86 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  39.53 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  35 
 
 
163 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  37.21 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  35 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  34.43 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  43.16 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  31.3 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  38.28 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  35.82 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  31.3 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  36.67 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  42.22 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  32.06 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  39.18 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  31.3 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  37.5 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  37.9 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  31.3 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  31.88 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  42.11 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  30.53 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  33.61 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  37.5 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  31.3 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  31.3 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  31.3 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>