233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4230 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
268 aa  551  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  50.25 
 
 
253 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  42.61 
 
 
260 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  40.98 
 
 
276 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  33.62 
 
 
257 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  38.03 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  38.27 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  37.02 
 
 
243 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  37.21 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  33.48 
 
 
255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  32.46 
 
 
417 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  32.89 
 
 
417 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  33.33 
 
 
468 aa  128  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  37.7 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  38.01 
 
 
292 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  34.53 
 
 
412 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  35.29 
 
 
886 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  29.77 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  32 
 
 
245 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  31.05 
 
 
405 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  29.2 
 
 
261 aa  116  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  41.07 
 
 
474 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  32.99 
 
 
217 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  32.26 
 
 
563 aa  102  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  31.58 
 
 
249 aa  102  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.62 
 
 
1771 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  31.58 
 
 
265 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  37.6 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  29.74 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  26.12 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  29.77 
 
 
2334 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  30.67 
 
 
384 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  31.62 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  26.36 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3911  peptidase-like protein  32.18 
 
 
286 aa  62.4  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.363292  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3140  phospholipase/carboxylesterase  23.74 
 
 
240 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0649605  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2341  putative esterase  29.3 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416263  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.25 
 
 
363 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  21.46 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  28.24 
 
 
640 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  28.22 
 
 
795 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  27.23 
 
 
406 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1473  putative esterase  28.74 
 
 
381 aa  59.7  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.305881  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  26.48 
 
 
343 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  28.25 
 
 
317 aa  58.9  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2242  Alpha/beta hydrolase fold-3  28 
 
 
333 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3614  putative esterase  28.48 
 
 
315 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  26.95 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3253  putative esterase  26.95 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5115  putative esterase  26.95 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  25.95 
 
 
372 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  26.13 
 
 
367 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2825  putative esterase  25.52 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.15 
 
 
328 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  37.84 
 
 
326 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  27.19 
 
 
344 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2308  putative esterase  30.95 
 
 
270 aa  55.8  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  37.84 
 
 
323 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3361  putative esterase  30.99 
 
 
369 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.151349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  26.84 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  31.37 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0686  phospholipase/carboxylesterase  25.39 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3306  phospholipase/carboxylesterase family protein  23.29 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1255  putative esterase  29.41 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  25.29 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1578  putative esterase  27.64 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.469655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  30.99 
 
 
378 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5901  putative esterase  26.43 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3530  putative esterase  27.21 
 
 
302 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4144  putative esterase  29.41 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  27.4 
 
 
1002 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  25.11 
 
 
850 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  26.99 
 
 
357 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  26.79 
 
 
816 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  41.27 
 
 
232 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3861  enterochelin esterase and related enzymes-like  28.25 
 
 
352 aa  52.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  31.31 
 
 
816 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  31.4 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  32.03 
 
 
490 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  25.17 
 
 
357 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  26.73 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0789  phospholipase/carboxylesterase  27.93 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5051  putative esterase  28.1 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  29.93 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  22.75 
 
 
752 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4526  putative esterase  28.1 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3946  phospholipase/carboxylesterase  27.43 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  22.75 
 
 
752 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  22.75 
 
 
752 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  27.56 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1536  putative esterase  28.17 
 
 
341 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.88087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  26.58 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2502  putative esterase  27.27 
 
 
360 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.519739  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  29.13 
 
 
777 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0523  putative esterase  27.41 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00718904  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  29.93 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1644  putative esterase  27.61 
 
 
328 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1530  putative esterase  24.36 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547916  normal  0.0514313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  24.06 
 
 
355 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  27.78 
 
 
334 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>