113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1687 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  100 
 
 		 552 aa  1142    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.18 
 
 		 556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.83 
 
 		 558 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  43.26 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  42.12 
 
 		 561 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  41.89 
 
 		 561 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.68 
 
 		 562 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  42.86 
 
 		 555 aa  435  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  41.76 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  41.35 
 
 		 566 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  40.25 
 
 		 566 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  42.06 
 
 		 549 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  37.2 
 
 		 583 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  40.79 
 
 		 567 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.41 
 
 		 583 aa  392  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  37.06 
 
 		 583 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.06 
 
 		 583 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  40.25 
 
 		 567 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37.83 
 
 		 584 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.71 
 
 		 567 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  36.52 
 
 		 597 aa  380  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  38.85 
 
 		 567 aa  377  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  38.92 
 
 		 572 aa  372  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  37 
 
 		 584 aa  369  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.93 
 
 		 548 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  37.23 
 
 		 566 aa  365  1e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  36.27 
 
 		 582 aa  364  3e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.74 
 
 		 548 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.85 
 
 		 548 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  37.57 
 
 		 568 aa  360  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  36.8 
 
 		 566 aa  360  3e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  37.23 
 
 		 570 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  38.56 
 
 		 548 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  39.17 
 
 		 542 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  37.92 
 
 		 571 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  35.81 
 
 		 565 aa  355  2e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.65 
 
 		 570 aa  354  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.81 
 
 		 543 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.97 
 
 		 543 aa  343  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.65 
 
 		 566 aa  337  5e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.79 
 
 		 569 aa  337  5e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  37.43 
 
 		 578 aa  336  7.999999999999999e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  35.4 
 
 		 568 aa  335  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.28 
 
 		 570 aa  333  4e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  40.45 
 
 		 424 aa  54.3  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  31.37 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  44.44 
 
 		 431 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  41.18 
 
 		 484 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  39.13 
 
 		 435 aa  51.2  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.23 
 
 		 425 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  33.33 
 
 		 422 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  30.77 
 
 		 425 aa  50.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  32.93 
 
 		 436 aa  50.4  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  32.93 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  33 
 
 		 484 aa  49.3  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  40.62 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.73 
 
 		 425 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  38.24 
 
 		 484 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  38.14 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  37 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  34.15 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  43.28 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  35.9 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  39.39 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.71 
 
 		 429 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.97 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  35.16 
 
 		 429 aa  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  32.1 
 
 		 426 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.23 
 
 		 424 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  31.48 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  37.11 
 
 		 423 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6046  D-aminoacylase domain protein  37.5 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  39.71 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  33.33 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  39.71 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  39.71 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  45.45 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.46 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  33.33 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 429 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  38.24 
 
 		 484 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  38.81 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  33.33 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  33.33 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  38.24 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.74 
 
 		 419 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  38.81 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  31.25 
 
 		 386 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.22 
 
 		 473 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  39.39 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.24 
 
 		 425 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  39.02 
 
 		 454 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  47.62 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  37.88 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4066  dihydropyrimidinase  35.38 
 
 		 479 aa  45.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  39.39 
 
 		 427 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  40.62 
 
 		 448 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>