262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2480 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 317 aa  627  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  41.7 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  42.8 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  39.39 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  44.26 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  41.73 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  43.83 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  37.91 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  41.29 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  39.41 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  36.11 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  35.38 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0656  rod shape-determining protein MreC  34.7 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0227203  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  32.66 
 
 		 300 aa  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 		 300 aa  99.8  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  32.72 
 
 		 357 aa  90.9  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 		 272 aa  89.4  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  29.37 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  33.19 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  28.38 
 
 		 282 aa  85.9  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  28.31 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  26.96 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  29.85 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.2 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  28.7 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  29.84 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  32.49 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  28.47 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  26.18 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  24.58 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  33.74 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  29.07 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  31.46 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  28.43 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  28.24 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  33.68 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  29.36 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  34.29 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  30.37 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  33.71 
 
 		 359 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  33.71 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  31.11 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  28.33 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  33.71 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  33.71 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  33.71 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  29.91 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  31.07 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  31 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  35.54 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  25.19 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  27.01 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  24.84 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  32.5 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  31.07 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  35.12 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  26.54 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  26.72 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  33.96 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  30.61 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  26.11 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  26.43 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>