200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1493 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  65.02 
 
 		 210 aa  262  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  60.94 
 
 		 213 aa  236  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  60.94 
 
 		 213 aa  236  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  60.42 
 
 		 213 aa  231  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  58.33 
 
 		 212 aa  225  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  57.81 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  58.33 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  58.33 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  58.33 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  57.95 
 
 		 213 aa  224  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  58.33 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  58.55 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  58.33 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  58.33 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  58.33 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  58.33 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  58.33 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  59.59 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  58.33 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  57.51 
 
 		 215 aa  222  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  57.81 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  57.73 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  57.29 
 
 		 213 aa  218  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4339  DNA-binding transcriptional repressor FabR  53.85 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000022912  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0137  DNA-binding transcriptional repressor FabR  53.33 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0163  DNA-binding transcriptional repressor FabR  53.89 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0230  DNA-binding transcriptional repressor FabR  53.89 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4711  DNA-binding transcriptional repressor FabR  53.33 
 
 		 204 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0124  DNA-binding transcriptional repressor FabR  54.4 
 
 		 205 aa  207  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000427607  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0192  DNA-binding transcriptional repressor FabR  52.08 
 
 		 204 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0188643  normal  0.031406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  52.08 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0177  DNA-binding transcriptional repressor FabR  52.08 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0172  DNA-binding transcriptional repressor FabR  52.08 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291893  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0178  DNA-binding transcriptional repressor FabR  52.08 
 
 		 204 aa  201  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155373  normal  0.944765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3541  DNA-binding transcriptional repressor FabR  52.08 
 
 		 204 aa  201  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0175  DNA-binding transcriptional repressor FabR  51.81 
 
 		 204 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0179  DNA-binding transcriptional repressor FabR  51.81 
 
 		 204 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00396424  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4180  DNA-binding transcriptional repressor FabR  51.81 
 
 		 204 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0026827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4078  DNA-binding transcriptional repressor FabR  51.81 
 
 		 204 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  52.85 
 
 		 199 aa  194  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  50.76 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  49.21 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  36.17 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  35.88 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 244 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 222 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  36.21 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4916  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715752  hitchhiker  0.000000000695443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4652  TetR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104872  hitchhiker  0.00491998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4859  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203125  hitchhiker  0.0000563821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4737  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 222 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0397829  hitchhiker  0.000000987598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  30.26 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5663  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3068  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0906512  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1912  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0359  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44540  hypothetical protein  33.09 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.389288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3792  hypothetical protein  32.62 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1730  regulatory protein, TetR  34.23 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0892  hypothetical protein  32.2 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1526  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.97703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2619  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0254896  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1957  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0421083  normal  0.138407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2300  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3820  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1272  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 271 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.57 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>