233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0886 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  100 
 
 		 316 aa  618  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  56.37 
 
 		 318 aa  345  7e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  56.69 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  56.37 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  56.69 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  56.05 
 
 		 318 aa  335  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  56.05 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  56.05 
 
 		 318 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  56.05 
 
 		 318 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  56.05 
 
 		 318 aa  331  9e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  54.14 
 
 		 330 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  56.05 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  49.36 
 
 		 318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  48.73 
 
 		 318 aa  295  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  45.4 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  44.62 
 
 		 316 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  36.68 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  35.74 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  39.68 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  40.63 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  40.39 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  40.65 
 
 		 313 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  40.73 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  40.26 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  40.26 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  39.02 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  39.02 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  39.02 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  39.68 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  39.31 
 
 		 318 aa  196  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  40.25 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  40.25 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  40.25 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  41.06 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  37.21 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  35.62 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  39.26 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  36.03 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  36.89 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  29.3 
 
 		 315 aa  137  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  33.33 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  29.17 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  30.69 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  31.51 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  31.94 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  28.62 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  27.99 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  31.07 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  32.29 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  31.94 
 
 		 314 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  25.95 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  31.43 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  29.75 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  31.07 
 
 		 315 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  27.85 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  26.81 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  29.72 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  26.35 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  27.4 
 
 		 339 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  28.14 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  28.14 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  29.19 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  29.72 
 
 		 308 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  26.35 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  24.6 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.09 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  30.34 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  26.01 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  27.03 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  26.01 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  26.01 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  29.17 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  23.36 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.7 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  28.86 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  28.03 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  24.09 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  22.77 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  23.93 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  28.83 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  28.92 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  21.82 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>