More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3462 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3462  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0534254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1212  ABC transporter related  62.35 
 
 		 267 aa  322  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00512006  hitchhiker  0.000000000503976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  62.3 
 
 		 248 aa  321  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2195  ABC transporter, ATP-binding protein  59.51 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00836348 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0450  ABC transporter related  58.8 
 
 		 254 aa  310  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5159  ABC transporter related protein  59.84 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364497 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  57.89 
 
 		 250 aa  304  7e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07670  ABC transporter, ATP-binding protein  57.09 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0821592  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1498  ABC transporter related  55.6 
 
 		 256 aa  288  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1034  ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 		 244 aa  265  5.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000170601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  46.28 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  45.38 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2596  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.256414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  43.46 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  41 
 
 		 296 aa  198  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  43.33 
 
 		 248 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1066  ABC transporter related  43.51 
 
 		 248 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2458  ABC transporter, ATPase subunit  41.91 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227376  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1121  ABC transporter related  41.91 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.418609  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3182  ABC transporter related  40.83 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1851  ABC transporter related  40.65 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3315  ABC transporter related  41.77 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000690504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1328  ABC transporter related  41.45 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0917234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3484  ABC transporter related  39.66 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  41.25 
 
 		 248 aa  188  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0706  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0407  ABC transporter component  40.51 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1977  ABC transporter related  42.63 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2869  ABC transporter related  41.49 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1737  ABC transporter related  41.18 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0169856  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  39.92 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  38.66 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2380  ABC transporter  39.75 
 
 		 257 aa  184  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83089  normal  0.615068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0015  ABC transporter related  40.59 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0891779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  40.59 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1998  ABC transporter-related protein  42.49 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2083  ABC transporter related  42.49 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1781  ABC transporter related  41.32 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.122728 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  43.1 
 
 		 262 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1578  ABC transporter related  41.77 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  41.43 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  39.24 
 
 		 248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3691  ABC transporter related  38.74 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.896312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  37.99 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1862  ABC transporter, ATPase subunit  42.37 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  41.3 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0448  ABC-type transport system, ATPase component  38.98 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392883  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0189  ABC transporter related  39.24 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0746681  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  40 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  40.42 
 
 		 268 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5282  ABC transporter related  38.82 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  38.4 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  37.24 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  37.56 
 
 		 257 aa  174  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2985  ABC-type organic solvent transporter, ATP-binding protein  39.75 
 
 		 257 aa  174  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.444132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  36.1 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  38.57 
 
 		 298 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  35.17 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  38.29 
 
 		 261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  38.94 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0997  ABC transporter-like protein protein  40.56 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0883738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  41.43 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 363 aa  171  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  37.13 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.13 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3546  amino acid ABC transporter-like protein  40.53 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  41.78 
 
 		 340 aa  170  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  35.77 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3548  L-cystine import ATP-binding protein TcyN  40.97 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.159589  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  40.44 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  39.51 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0925  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2542  ABC transporter-related protein  39.26 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120611  hitchhiker  0.000000000000186562 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  41.99 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1926  ABC transporter related  38.53 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0371  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  38.62 
 
 		 245 aa  169  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2429  ABC transporter for histidine/lysine/arginine/ornithine ATP-binding protein  39.26 
 
 		 242 aa  168  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.037997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3884  ABC transporter-related protein  36.1 
 
 		 351 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  36.44 
 
 		 266 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_002978  WD0990  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.491255  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  42.99 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  37.97 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2673  ABC transporter-like  40.24 
 
 		 260 aa  165  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  37.04 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3513  ABC transporter related  38.22 
 
 		 348 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721065  normal  0.699541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3573  ABC transporter related  38.22 
 
 		 348 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.736918  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  37.91 
 
 		 265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3500  ABC transporter related  38.22 
 
 		 348 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1811  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0961  ABC transporter, ATP-binding protein  37.73 
 
 		 352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  36.36 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  33.89 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  35.86 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0935  ABC transporter-related protein  38.84 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  37.13 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0796  ABC transporter related  35.42 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0646  ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  35.44 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>