More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4268 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  74.89 
 
 		 237 aa  345  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  69.7 
 
 		 237 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  69.7 
 
 		 237 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  65.79 
 
 		 234 aa  318  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  67.98 
 
 		 237 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  66.67 
 
 		 233 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  67.11 
 
 		 234 aa  314  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  65.79 
 
 		 233 aa  314  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  65.79 
 
 		 233 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  65.79 
 
 		 233 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  65.35 
 
 		 233 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  63.79 
 
 		 235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  62.28 
 
 		 231 aa  293  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  59.13 
 
 		 231 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  59.13 
 
 		 231 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.7 
 
 		 231 aa  287  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  63.91 
 
 		 236 aa  281  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  51.72 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  51.29 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  53.71 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  50.21 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  50.43 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  48.92 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  49.78 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  48.47 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  51.5 
 
 		 236 aa  224  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  49.78 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  48.47 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  48.28 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  50 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  46.29 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  47.19 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  47.44 
 
 		 243 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  46.98 
 
 		 234 aa  218  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  49.14 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  47.92 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  46.55 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  47.62 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  47.5 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  47.37 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  47.19 
 
 		 248 aa  215  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  48.91 
 
 		 230 aa  216  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  48.02 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  47.88 
 
 		 236 aa  214  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  46.22 
 
 		 237 aa  214  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  50 
 
 		 245 aa  214  9e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  46.55 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  47.16 
 
 		 254 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  46.05 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  47.28 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  45.26 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  46.96 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  48.46 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 		 241 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  48.28 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  47.19 
 
 		 232 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  45.76 
 
 		 247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  45.73 
 
 		 233 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  48.29 
 
 		 237 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  48.21 
 
 		 246 aa  211  5.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  46.84 
 
 		 239 aa  211  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  46.19 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2313  ABC transporter related  45.02 
 
 		 236 aa  211  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  47.39 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  45.15 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  45.53 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  49.14 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.6 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  44.74 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  47.6 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  46.35 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  47.16 
 
 		 251 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  47.03 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  46.32 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  46.38 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  47.16 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  46.75 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  47.6 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  48.28 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  46.78 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  47.44 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  44.87 
 
 		 239 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 		 246 aa  207  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  45.11 
 
 		 241 aa  207  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  46.78 
 
 		 251 aa  207  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 235 aa  207  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  47.16 
 
 		 248 aa  207  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  46.58 
 
 		 235 aa  207  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.44 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  47.44 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  47.44 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>