More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1004 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  52.38 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  53.06 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  51.7 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  51.7 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  47.89 
 
 		 149 aa  141  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  47.89 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  54.42 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  42.66 
 
 		 153 aa  123  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  37.76 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  36.3 
 
 		 147 aa  116  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  36.05 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  38.1 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0960  CBS domain-containing protein  39.19 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0461508  hitchhiker  0.00174257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  32.65 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  31.72 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  35.37 
 
 		 246 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1597  CBS domain containing membrane protein  35.14 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.105679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1925  CBS domain protein  35.14 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  36.36 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  34.51 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  34.93 
 
 		 247 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 149 aa  94.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 		 246 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  37.41 
 
 		 230 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 241 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  32.87 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  35.14 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.65 
 
 		 230 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  31.47 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  36.73 
 
 		 230 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  32.47 
 
 		 229 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  31.94 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  31.94 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  33.55 
 
 		 229 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  32.86 
 
 		 160 aa  84.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  33.77 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  31.94 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  36.17 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30.41 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  31.33 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  29.66 
 
 		 423 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 242 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  29.86 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  32.43 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17501  IMP dehydrogenase-like protein  28.77 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  29.22 
 
 		 339 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  32.87 
 
 		 233 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.77 
 
 		 226 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  31.41 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.33 
 
 		 338 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  30.56 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.86 
 
 		 628 aa  71.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  28.77 
 
 		 249 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  29.66 
 
 		 243 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  29.29 
 
 		 333 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  29.17 
 
 		 242 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.65 
 
 		 873 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1182  putative transcriptional regulator, XRE family  25.85 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000705125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  28.47 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  32.39 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  29.58 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  33.1 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  31.08 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  27.66 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  28.57 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.17 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  28 
 
 		 339 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  29.61 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  28.47 
 
 		 904 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  30.28 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  29.73 
 
 		 348 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  34.23 
 
 		 378 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  29.17 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  31.43 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  31.72 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 863 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  26.71 
 
 		 880 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  28.67 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  29.14 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.64 
 
 		 256 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  33.56 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1929  CBS domain containing protein  28.87 
 
 		 875 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  30.2 
 
 		 307 aa  63.9  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2294  CBS domain containing protein  29.58 
 
 		 875 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  29.66 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  29.17 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  26.21 
 
 		 877 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  24.83 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.17 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  28.66 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  28.95 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  28.28 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  28.47 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  26.39 
 
 		 907 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  27.45 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>