147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1808 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0535  CBS domain-containing protein  73.01 
 
 
658 aa  1006    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.672261  normal  0.0583682 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1808  signal-transduction protein  100 
 
 
655 aa  1296    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  74.66 
 
 
660 aa  984    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1618  signal transduction protein  74.2 
 
 
656 aa  980    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  28.85 
 
 
281 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  25.91 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  24.28 
 
 
282 aa  62  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  25.24 
 
 
279 aa  61.2  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  22.03 
 
 
423 aa  60.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  23.36 
 
 
279 aa  59.7  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
242 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  23.79 
 
 
427 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  23.21 
 
 
399 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  30.4 
 
 
186 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  23.74 
 
 
411 aa  55.5  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  23.61 
 
 
380 aa  55.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  31.41 
 
 
234 aa  55.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  26.09 
 
 
217 aa  54.7  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0468  CBS domain containing membrane protein  24.5 
 
 
195 aa  54.3  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2974  CBS domain containing protein  27.42 
 
 
417 aa  54.3  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  32.43 
 
 
503 aa  53.9  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  22.41 
 
 
427 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  28.8 
 
 
188 aa  53.5  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  28.32 
 
 
226 aa  53.5  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1849  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  36.45 
 
 
633 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  25.32 
 
 
277 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  26.21 
 
 
428 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  25.32 
 
 
295 aa  53.1  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1919  CBS domain containing protein  24.29 
 
 
409 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  26.97 
 
 
227 aa  52.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  27.07 
 
 
309 aa  52  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  28.85 
 
 
230 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  25.41 
 
 
404 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  28 
 
 
186 aa  52  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  28.8 
 
 
186 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  26.42 
 
 
153 aa  51.6  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  32.8 
 
 
246 aa  52  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  28.95 
 
 
232 aa  50.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  45.16 
 
 
402 aa  50.8  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  23.76 
 
 
256 aa  50.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1393  signal transduction protein  26.67 
 
 
136 aa  50.4  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.137975 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1119  signal-transduction protein  35.24 
 
 
615 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  27.5 
 
 
502 aa  50.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  24.39 
 
 
431 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  26.14 
 
 
373 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  27.17 
 
 
232 aa  50.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  26.67 
 
 
339 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0826  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  33.33 
 
 
540 aa  49.7  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  23.12 
 
 
155 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2435  CBS domain containing membrane protein  28.93 
 
 
168 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2138  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 
151 aa  49.7  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  26.85 
 
 
144 aa  49.3  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  27.75 
 
 
226 aa  48.9  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 
246 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  24.57 
 
 
261 aa  48.5  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  26.25 
 
 
144 aa  48.5  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  30.46 
 
 
249 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  28.31 
 
 
333 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  27.59 
 
 
372 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  28.42 
 
 
221 aa  48.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  29.09 
 
 
375 aa  47.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  25.95 
 
 
389 aa  47.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  25.15 
 
 
149 aa  47.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  21.84 
 
 
258 aa  47.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  25 
 
 
153 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  38.81 
 
 
427 aa  47.8  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.1 
 
 
230 aa  47.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  23.49 
 
 
302 aa  47.4  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  35.37 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30 
 
 
161 aa  47  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  39.29 
 
 
447 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  29.88 
 
 
154 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 
152 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  26.83 
 
 
224 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  28.78 
 
 
247 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  27.84 
 
 
128 aa  47  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  43.14 
 
 
412 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  25.71 
 
 
290 aa  47  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  37.31 
 
 
453 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  27.33 
 
 
230 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  29.05 
 
 
151 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  29.86 
 
 
170 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2843  CBS domain containing protein  37.5 
 
 
267 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0285947  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  24.23 
 
 
412 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6942  CBS domain-containing protein  37.74 
 
 
142 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  24.16 
 
 
223 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  33.73 
 
 
215 aa  46.2  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  25.74 
 
 
366 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  30.25 
 
 
145 aa  46.6  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  23.37 
 
 
226 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0458  peptidase M50  26.96 
 
 
377 aa  46.2  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0639554  normal  0.134701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  26.14 
 
 
149 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  27.21 
 
 
503 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 
228 aa  45.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  35.53 
 
 
203 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  22.61 
 
 
262 aa  45.8  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  25.09 
 
 
291 aa  45.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  41.18 
 
 
428 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  32.53 
 
 
215 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2704  CBS domain containing protein  25.29 
 
 
158 aa  45.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>