More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3009 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  100 
 
 
402 aa  793    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  68.07 
 
 
426 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  65.84 
 
 
429 aa  482  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  62.16 
 
 
445 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  56.93 
 
 
424 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  59.65 
 
 
447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  57.24 
 
 
474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  58.09 
 
 
431 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  57.97 
 
 
435 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  56.76 
 
 
427 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  55.56 
 
 
412 aa  426  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  56.4 
 
 
428 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  57.18 
 
 
427 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  57.21 
 
 
435 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  55.96 
 
 
454 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0802  MgtE intracellular region  55.28 
 
 
416 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  59.95 
 
 
430 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  54.26 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  53.62 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  54.22 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  52.09 
 
 
422 aa  401  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  50.72 
 
 
432 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2913  MgtE intracellular region  55.09 
 
 
430 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.553029  normal  0.0535058 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  50.48 
 
 
431 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  50.48 
 
 
431 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4488  MgtE intracellular region  49.76 
 
 
431 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.837041  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  50.36 
 
 
438 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  50.12 
 
 
417 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  52.17 
 
 
453 aa  358  6e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11257  hypothetical protein  49.28 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1681  MgtE intracellular region  48.9 
 
 
431 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106965  normal  0.399701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1195  MgtE intracellular region  47.72 
 
 
427 aa  352  8.999999999999999e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  32.78 
 
 
421 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  27.87 
 
 
430 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  27.47 
 
 
426 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  32.84 
 
 
413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  29.26 
 
 
625 aa  137  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  28.57 
 
 
420 aa  136  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7400  hypothetical protein  28.82 
 
 
430 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.090921  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  26.07 
 
 
433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  28.16 
 
 
459 aa  126  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  35.19 
 
 
542 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0595  CBS domain-containing protein  29.72 
 
 
418 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297001  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  34.89 
 
 
453 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  35.47 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  33.33 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  36.56 
 
 
450 aa  112  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  30.12 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  34.86 
 
 
460 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  32.6 
 
 
454 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  35.14 
 
 
452 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  30.8 
 
 
451 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  29.88 
 
 
449 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  22.96 
 
 
423 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  22.96 
 
 
423 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  29.33 
 
 
453 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  31.58 
 
 
450 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  32.17 
 
 
442 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  33.63 
 
 
463 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  35 
 
 
462 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  35.42 
 
 
462 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  26.81 
 
 
412 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  32.65 
 
 
444 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  30.83 
 
 
463 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  32.37 
 
 
465 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  33.33 
 
 
486 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  32.37 
 
 
465 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0843  magnesium transporter  31 
 
 
449 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  31.17 
 
 
446 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  24.87 
 
 
425 aa  99.8  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  32.66 
 
 
465 aa  99.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3303  magnesium transporter  31.12 
 
 
461 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  31.22 
 
 
466 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  31.47 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  34.08 
 
 
486 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  33.19 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  33.18 
 
 
469 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  31.73 
 
 
471 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  32.19 
 
 
458 aa  97.1  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  33.18 
 
 
469 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2001  magnesium transporter  34.36 
 
 
447 aa  96.3  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  35.78 
 
 
467 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4800  magnesium transporter  32.8 
 
 
456 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832783  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02891  magnesium transporter  33.2 
 
 
455 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  26.64 
 
 
445 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  32.89 
 
 
468 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  29.2 
 
 
452 aa  94.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  36.7 
 
 
456 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  30.77 
 
 
447 aa  93.6  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  28.07 
 
 
454 aa  93.2  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3903  magnesium transporter  33.33 
 
 
456 aa  93.2  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508399  normal  0.721995 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  32.46 
 
 
468 aa  93.2  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  30.83 
 
 
473 aa  93.2  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  35.23 
 
 
461 aa  92.8  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  27.07 
 
 
449 aa  92.8  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5457  magnesium transporter  32.93 
 
 
456 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.169675 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  27.63 
 
 
454 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  30.84 
 
 
451 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2069  magnesium transporter  28.03 
 
 
471 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1866  magnesium transporter  28.03 
 
 
471 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165676  normal  0.0535205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>