292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0122 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  100 
 
 
454 aa  886    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  62.08 
 
 
445 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  63.39 
 
 
429 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  55.75 
 
 
474 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  58.8 
 
 
412 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  58.84 
 
 
447 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  54.79 
 
 
424 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  56.31 
 
 
426 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  58.37 
 
 
435 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  56.73 
 
 
431 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  54.88 
 
 
427 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0802  MgtE intracellular region  55.77 
 
 
416 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  59.17 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  55.24 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  53.73 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  54.01 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  54.99 
 
 
402 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  57.31 
 
 
430 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4488  MgtE intracellular region  53.07 
 
 
431 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.837041  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  55.18 
 
 
428 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  51.65 
 
 
432 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  51.42 
 
 
431 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  51.42 
 
 
431 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  54.26 
 
 
427 aa  382  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2913  MgtE intracellular region  55.12 
 
 
430 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.553029  normal  0.0535058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1681  MgtE intracellular region  52.06 
 
 
431 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106965  normal  0.399701 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  49.02 
 
 
422 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  51.47 
 
 
417 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11257  hypothetical protein  49.31 
 
 
435 aa  361  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1195  MgtE intracellular region  50.12 
 
 
427 aa  360  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  47.42 
 
 
438 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  50.58 
 
 
453 aa  339  5.9999999999999996e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  32.78 
 
 
421 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  28.4 
 
 
426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  29.12 
 
 
430 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  30.33 
 
 
625 aa  153  7e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  34.97 
 
 
413 aa  148  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  27.06 
 
 
420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  27.31 
 
 
459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0595  CBS domain-containing protein  31.48 
 
 
418 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297001  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  28.57 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7400  hypothetical protein  29.93 
 
 
430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.090921  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  23.68 
 
 
423 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  23.42 
 
 
423 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  35.36 
 
 
452 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  29.23 
 
 
412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  33.19 
 
 
453 aa  121  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  25.12 
 
 
417 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  28.82 
 
 
449 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  32.92 
 
 
449 aa  116  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0092  MgtE intracellular region  26.56 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0286357 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  36.84 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  38.05 
 
 
453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  25.48 
 
 
425 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  34.73 
 
 
444 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  30.97 
 
 
542 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  33.04 
 
 
452 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  31.47 
 
 
446 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  29.82 
 
 
454 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2421  magnesium transporter  33.04 
 
 
450 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545313  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  35.14 
 
 
460 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  28.98 
 
 
454 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  30.8 
 
 
446 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  29.39 
 
 
454 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  29.39 
 
 
454 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  31.14 
 
 
454 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  31.28 
 
 
449 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  30 
 
 
450 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  33.9 
 
 
454 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  28.69 
 
 
451 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  28.51 
 
 
454 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  29.52 
 
 
461 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  29.52 
 
 
461 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  32.02 
 
 
449 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  30.13 
 
 
445 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  31.08 
 
 
452 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  29.39 
 
 
454 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  28.95 
 
 
454 aa  99  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  28.95 
 
 
454 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  28.95 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  28.95 
 
 
454 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  28.95 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2231  magnesium transporter  33.33 
 
 
450 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.555024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  29.72 
 
 
454 aa  98.2  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  29.39 
 
 
453 aa  97.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  29.91 
 
 
451 aa  96.3  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  32.46 
 
 
451 aa  96.3  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  31.39 
 
 
454 aa  95.9  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  32.52 
 
 
465 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  32.52 
 
 
465 aa  95.5  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  30.92 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2199  divalent cation transporter  34.73 
 
 
465 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  31.62 
 
 
451 aa  94  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1386  magnesium transporter  29.74 
 
 
485 aa  94  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  34.17 
 
 
454 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  32.59 
 
 
452 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  28.03 
 
 
454 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  32.16 
 
 
453 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  28.29 
 
 
442 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4791  putative magnesium transporter MgtE-like (divalent cation transporter Mg2+/Ni2+/Co2+)  30.8 
 
 
472 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>