59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2435 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2435  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 168 aa  347  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.118625 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2434  CBS domain containing membrane protein  46.36 
 
 		 168 aa  154  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0700724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  30.99 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  29.14 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  30.28 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  39.68 
 
 		 660 aa  54.3  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 431 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1618  signal transduction protein  29.75 
 
 		 656 aa  53.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0535  CBS domain-containing protein  28.1 
 
 		 658 aa  50.8  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.672261  normal  0.0583682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  30.28 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  24.83 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1808  signal-transduction protein  28.93 
 
 		 655 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  25.69 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  40.91 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  48.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  26.47 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  24.66 
 
 		 426 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  26.8 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  26.53 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  25.83 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3486  CBS domain-containing protein  26.49 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000172668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  25.5 
 
 		 136 aa  44.7  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  25.83 
 
 		 226 aa  44.3  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  25.5 
 
 		 427 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  27.69 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  34.51 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  26.85 
 
 		 423 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  28.05 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  24.82 
 
 		 232 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1513  CBS domain-containing protein  27.52 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  26.76 
 
 		 279 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  34.38 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4840  signal-transduction protein containing cAMP- binding and CBS domains-like protein  23.84 
 
 		 222 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  23.4 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  25.52 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  43.4 
 
 		 145 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  37.04 
 
 		 150 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  28.43 
 
 		 490 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1632  CBS domain-containing protein  24.8 
 
 		 211 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0668  putative signal transduction protein with CBS domains  27.92 
 
 		 184 aa  42  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  23.93 
 
 		 370 aa  42  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  25.69 
 
 		 153 aa  42  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  27.7 
 
 		 428 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  26.97 
 
 		 490 aa  42  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  24.65 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  19.21 
 
 		 282 aa  41.6  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  26.5 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 		 385 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  38.89 
 
 		 332 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  26.32 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1919  CBS domain containing protein  29.6 
 
 		 409 aa  41.2  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  28.67 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  32.76 
 
 		 598 aa  41.2  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1712  Inorganic diphosphatase  33.87 
 
 		 542 aa  41.2  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  38.46 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  23.45 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  32 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 		 149 aa  40.8  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>