117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6942 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6942  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  264  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  55.56 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  34.88 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  44.44 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  40.74 
 
 		 242 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  42.59 
 
 		 226 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  46.3 
 
 		 249 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  44.44 
 
 		 242 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  47.27 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  45.45 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  38.89 
 
 		 229 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  42.59 
 
 		 225 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  34.55 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1659  signal transduction protein  43.4 
 
 		 660 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  41.51 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  38.89 
 
 		 230 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  37.29 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  40 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  44.44 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  38.89 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  41.51 
 
 		 295 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  40.74 
 
 		 243 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  43.64 
 
 		 266 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  44.44 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  40.74 
 
 		 243 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  39.62 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  42.19 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  43.4 
 
 		 232 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  40.58 
 
 		 339 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.89 
 
 		 243 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 262 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1808  signal-transduction protein  37.74 
 
 		 655 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  42.59 
 
 		 241 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 242 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  30.97 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  38.46 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  32.14 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  31.01 
 
 		 191 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  40.58 
 
 		 339 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  38.89 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  28.33 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  37.74 
 
 		 234 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 		 228 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  30.53 
 
 		 208 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  30.53 
 
 		 208 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  38.89 
 
 		 243 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  43.64 
 
 		 199 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 		 215 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 		 338 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  45.45 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 		 204 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  45.45 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  45.45 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  39.06 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  41.51 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  40 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  34.13 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 256 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  38.6 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  37.93 
 
 		 368 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  35.19 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  47.83 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  45.1 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  40 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  39.62 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  36.36 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  35.09 
 
 		 503 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  33.9 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  37.93 
 
 		 281 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  32.58 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  35.38 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  42 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  40.38 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30.36 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5000  signal-transduction protein  37.04 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  40.74 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2843  CBS domain containing protein  38 
 
 		 267 aa  42  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0285947  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  38 
 
 		 261 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  37.08 
 
 		 161 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  39.62 
 
 		 155 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1650  putative CBS domain-containing signal transduction protein  34.52 
 
 		 218 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0992945  normal  0.691102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  35.19 
 
 		 379 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  35.85 
 
 		 149 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2618  CBS  34 
 
 		 275 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  33.85 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4379  signal-transduction protein  41.07 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  42.59 
 
 		 427 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  33.08 
 
 		 246 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2057  putative signal transduction protein with CBS domains  25.6 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2632  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.18 
 
 		 486 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  37.84 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  33.93 
 
 		 374 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  44.44 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0653  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  43.4 
 
 		 500 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  52.27 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  40.38 
 
 		 410 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>