More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3915 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3915  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 839 aa  1730    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.84 
 
 		 2213 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 1326 aa  284  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.89 
 
 		 1331 aa  283  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1238 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1234 aa  281  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 		 1236 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 1765 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1238 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1238 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1238 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 		 1236 aa  279  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 1236 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 1236 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 1165 aa  277  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1625 aa  277  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  31.38 
 
 		 1200 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 1234 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 1629 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 1267 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  33.77 
 
 		 1188 aa  275  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 1230 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  31.58 
 
 		 1236 aa  273  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1771 aa  272  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 1629 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 1768 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.02 
 
 		 1765 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.04 
 
 		 1233 aa  269  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.46 
 
 		 1763 aa  268  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 1767 aa  268  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 1767 aa  267  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1245 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 1767 aa  266  8e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 1340 aa  267  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 1611 aa  264  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1245 aa  265  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 920 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  33.09 
 
 		 1626 aa  262  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 1193 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  32.95 
 
 		 2035 aa  261  4e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 		 1622 aa  261  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 1784 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 		 1792 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 1255 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 		 1659 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 1782 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.6 
 
 		 923 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  31.02 
 
 		 1683 aa  254  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 		 1426 aa  254  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 1548 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  32.88 
 
 		 1417 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  32.56 
 
 		 1439 aa  252  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1786 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 1582 aa  252  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 981 aa  251  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 1397 aa  251  6e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 912 aa  250  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 1033 aa  250  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 1009 aa  250  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 1240 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 1788 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 1245 aa  249  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 		 921 aa  249  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 1560 aa  248  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 1643 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  32.69 
 
 		 1418 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.41 
 
 		 816 aa  246  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1603 aa  246  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  31.3 
 
 		 955 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  32.05 
 
 		 1001 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  32.47 
 
 		 1287 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 977 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 1021 aa  243  7.999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 1310 aa  243  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 957 aa  243  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  31.53 
 
 		 1214 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  30.96 
 
 		 940 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 1303 aa  241  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 		 1632 aa  241  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 720 aa  240  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 964 aa  240  9e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  30.56 
 
 		 1364 aa  239  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  31.8 
 
 		 1070 aa  238  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 1005 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 1303 aa  236  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 		 929 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 1166 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 1128 aa  234  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  31.83 
 
 		 1135 aa  233  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.76 
 
 		 1069 aa  233  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 1333 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01227  two-component hybrid sensor and regulator  30.4 
 
 		 699 aa  232  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 2654 aa  233  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 		 1369 aa  231  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 778 aa  231  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 		 801 aa  230  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.81 
 
 		 1442 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.64 
 
 		 918 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 649 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 		 1398 aa  229  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>