More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0019 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  82.8 
 
 		 562 aa  934    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  82.63 
 
 		 570 aa  904    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  79.65 
 
 		 570 aa  924    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  80.99 
 
 		 568 aa  922    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 551 aa  1126    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  81.37 
 
 		 566 aa  892    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  80.71 
 
 		 565 aa  928    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  40.23 
 
 		 520 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  39.63 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  40.76 
 
 		 535 aa  372  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  39.33 
 
 		 520 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  39.69 
 
 		 504 aa  362  1e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  38.55 
 
 		 516 aa  362  1e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  38.63 
 
 		 516 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  36.41 
 
 		 516 aa  338  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  37.18 
 
 		 543 aa  337  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  44.36 
 
 		 604 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  37.85 
 
 		 503 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  35.49 
 
 		 514 aa  327  4.0000000000000003e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  39.48 
 
 		 530 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  35.61 
 
 		 543 aa  323  7e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  39.13 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  36.23 
 
 		 494 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  37.7 
 
 		 496 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  37.4 
 
 		 531 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  37.3 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37.5 
 
 		 503 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  35.29 
 
 		 559 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  32.39 
 
 		 512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  36.66 
 
 		 702 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  34.91 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  34.91 
 
 		 496 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  36.75 
 
 		 562 aa  302  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  34.26 
 
 		 492 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  33.02 
 
 		 515 aa  298  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  33.9 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  35.36 
 
 		 908 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  32.22 
 
 		 525 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  35.79 
 
 		 1427 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  34.27 
 
 		 990 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  37.7 
 
 		 500 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  36.23 
 
 		 1194 aa  290  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  33.27 
 
 		 564 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  37.5 
 
 		 503 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  37.7 
 
 		 507 aa  288  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000520175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0712  ribonuclease, Rne/Rng family  37.42 
 
 		 919 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  6.98043e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1256  ribonuclease  37.47 
 
 		 792 aa  286  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000740438  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  33.4 
 
 		 922 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0700  ribonuclease, Rne/Rng family  37.53 
 
 		 903 aa  286  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000181353  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  35.25 
 
 		 492 aa  286  8e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  35.57 
 
 		 1265 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  35.64 
 
 		 1113 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  35.21 
 
 		 1007 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  33.08 
 
 		 499 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  35.64 
 
 		 1151 aa  282  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  36.01 
 
 		 1117 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1467  ribonuclease  37.97 
 
 		 1031 aa  282  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00760754  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  35.85 
 
 		 1043 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  33.91 
 
 		 1041 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  33.2 
 
 		 497 aa  280  4e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  33.2 
 
 		 497 aa  280  5e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  34.56 
 
 		 974 aa  279  9e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  34.92 
 
 		 1058 aa  279  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  34.76 
 
 		 1093 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  32.41 
 
 		 483 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  36.14 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  33.33 
 
 		 487 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0715  ribonuclease E  32.9 
 
 		 942 aa  278  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.32082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  35.14 
 
 		 959 aa  276  5e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  34.49 
 
 		 1024 aa  276  8e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0921  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.3 
 
 		 808 aa  276  9e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00650126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  35.91 
 
 		 866 aa  276  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2546  ribonuclease E  37.17 
 
 		 806 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147077  hitchhiker  1.1855699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  34.26 
 
 		 502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  34.36 
 
 		 528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  34.57 
 
 		 528 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  33.46 
 
 		 1022 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  32.51 
 
 		 636 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  30.89 
 
 		 1093 aa  273  7e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  34.61 
 
 		 944 aa  273  7e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14810  Ribonuclease E  32.97 
 
 		 1139 aa  272  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  36.66 
 
 		 571 aa  272  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  34.78 
 
 		 500 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1592  ribonuclease E  33.91 
 
 		 1175 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.690225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  35.55 
 
 		 1080 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1736  ribonuclease, Rne/Rng family  33.4 
 
 		 496 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  33.77 
 
 		 489 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  32.65 
 
 		 1015 aa  270  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  33.89 
 
 		 490 aa  270  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2134  ribonuclease  34.28 
 
 		 1070 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2131  RNAse E  30.88 
 
 		 936 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162164  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0806  ribonuclease  30.88 
 
 		 890 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0942815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  33.99 
 
 		 489 aa  270  7e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  35.47 
 
 		 1070 aa  270  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  32.02 
 
 		 1065 aa  269  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  33.79 
 
 		 489 aa  269  8.999999999999999e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  32.71 
 
 		 489 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1321  ribonuclease E  32.95 
 
 		 904 aa  269  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0034947  normal  0.881501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1776  ribonuclease E  31.35 
 
 		 984 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000943072  decreased coverage  0.00020345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  35.44 
 
 		 687 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>