More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1478 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  69.59 
 
 		 543 aa  739    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  70.23 
 
 		 516 aa  738    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 514 aa  1046    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  53.61 
 
 		 520 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  55.31 
 
 		 516 aa  541  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  51.07 
 
 		 520 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  51.57 
 
 		 535 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  50.3 
 
 		 504 aa  495  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  48.83 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  49.71 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  35.83 
 
 		 565 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  34.44 
 
 		 562 aa  325  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  33.33 
 
 		 570 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  35.49 
 
 		 551 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  37.39 
 
 		 525 aa  306  8.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  41.65 
 
 		 604 aa  295  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  37.59 
 
 		 568 aa  282  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  32.99 
 
 		 494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  38.35 
 
 		 566 aa  273  6e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  36.42 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  37.72 
 
 		 570 aa  270  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  37.82 
 
 		 503 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  37.13 
 
 		 496 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  34.45 
 
 		 562 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  35.66 
 
 		 908 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  36.55 
 
 		 515 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  35.48 
 
 		 559 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  36.08 
 
 		 531 aa  257  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  35.33 
 
 		 489 aa  257  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  35.25 
 
 		 922 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  35.59 
 
 		 990 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  36.5 
 
 		 496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  33.9 
 
 		 702 aa  254  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  33 
 
 		 636 aa  254  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  32.7 
 
 		 512 aa  253  7e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  33.95 
 
 		 564 aa  253  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  34.94 
 
 		 1007 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  35.01 
 
 		 1427 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  34.84 
 
 		 1043 aa  251  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  34.29 
 
 		 1194 aa  250  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  34.46 
 
 		 497 aa  249  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  34.94 
 
 		 489 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  34.94 
 
 		 489 aa  249  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  31.78 
 
 		 496 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  31.78 
 
 		 496 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  34.29 
 
 		 1265 aa  249  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  34.44 
 
 		 457 aa  246  8e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  35.15 
 
 		 499 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  33.81 
 
 		 530 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  34.5 
 
 		 411 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  31.03 
 
 		 496 aa  243  7e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  33.49 
 
 		 492 aa  243  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  34.77 
 
 		 1018 aa  242  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  33.73 
 
 		 1244 aa  241  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  33.81 
 
 		 1117 aa  240  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  33.01 
 
 		 483 aa  240  5e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1353  ribonuclease E  36.88 
 
 		 938 aa  240  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000765938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  33.49 
 
 		 944 aa  239  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  35.77 
 
 		 713 aa  239  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  33.9 
 
 		 1041 aa  239  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  34.7 
 
 		 1334 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  34.31 
 
 		 959 aa  238  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  33.05 
 
 		 537 aa  237  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1067  RNAse E  34.81 
 
 		 640 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.232877  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  32.93 
 
 		 1058 aa  237  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  36.2 
 
 		 645 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19421  ribonuclease E/G  35.05 
 
 		 640 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.839153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  31.35 
 
 		 1022 aa  237  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  33.41 
 
 		 497 aa  236  6e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  35.42 
 
 		 687 aa  236  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0537  ribonuclease E  35.71 
 
 		 486 aa  236  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0321  ribonuclease  35.95 
 
 		 489 aa  236  9e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.691253  normal  0.292271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  32.56 
 
 		 485 aa  235  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  32.84 
 
 		 489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  32.87 
 
 		 497 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  34.91 
 
 		 938 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  33.25 
 
 		 952 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  35.23 
 
 		 808 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2376  ribonuclease, Rne/Rng family  36.84 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  32.69 
 
 		 1024 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  33.18 
 
 		 483 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  31.41 
 
 		 1093 aa  234  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  32.84 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  32.92 
 
 		 571 aa  233  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0977  ribonuclease  35.17 
 
 		 490 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.205612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  32.06 
 
 		 543 aa  233  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2185  ribonuclease E  34.26 
 
 		 1073 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0610467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  37.82 
 
 		 500 aa  233  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  33.17 
 
 		 717 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1619  RNAse E  34.06 
 
 		 1012 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0118741  normal  0.382079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3809  ribonuclease  34.26 
 
 		 1090 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000518974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  32.79 
 
 		 487 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0483  ribonuclease  35.35 
 
 		 682 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.582828  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1905  ribonuclease, Rne/Rng family  34.26 
 
 		 1091 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.879394  unclonable  0.000000947805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  35.84 
 
 		 653 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  35.84 
 
 		 653 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  33.64 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  33.83 
 
 		 495 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0656  ribonuclease E  34.64 
 
 		 998 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0756  ribonuclease, Rne/Rng family  35.8 
 
 		 741 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000069675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>