More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02680 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1532  ribonuclease  70.62 
 
 		 543 aa  771    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02680  Ribonuclease G  100 
 
 		 516 aa  1061    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1478  ribonuclease, Rne/Rng family  70.23 
 
 		 514 aa  738    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  52.83 
 
 		 520 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0126  ribonuclease, Rne/Rng family  53 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3689  ribonuclease G  53.29 
 
 		 535 aa  537  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0153  Rne/Rng family ribonuclease  49.52 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5979  ribonuclease, Rne/Rng family  49.71 
 
 		 520 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.62206  normal  0.425632 
 
 
-
 
NC_002950  PG1256  ribonuclease  49.6 
 
 		 504 aa  501  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0940  ribonuclease, Rne/Rng family  47.3 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0040  ribonuclease  34.55 
 
 		 565 aa  334  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0025  ribonuclease, Rne/Rng family  34.31 
 
 		 562 aa  333  6e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  36.41 
 
 		 551 aa  329  9e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000201428  unclonable  0.00000166802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0207  ribonuclease, Rne/Rng family  41.69 
 
 		 604 aa  300  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.295095  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0012  ribonuclease E and G  39.5 
 
 		 570 aa  294  3e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000376513  normal  0.207191 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0019  ribonuclease, Rne/Rng family  39.14 
 
 		 570 aa  279  9e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000156089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1989  ribonuclease E and G  37.69 
 
 		 568 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  32.28 
 
 		 512 aa  274  3e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  33.06 
 
 		 503 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  33.47 
 
 		 562 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0018  ribonuclease, Rne/Rng family  37.94 
 
 		 566 aa  266  7e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  35.59 
 
 		 525 aa  263  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  32.48 
 
 		 559 aa  256  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  34.53 
 
 		 531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  33.26 
 
 		 496 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  30.69 
 
 		 494 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  33.76 
 
 		 496 aa  254  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  33.26 
 
 		 496 aa  254  3e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  33.76 
 
 		 496 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  34.17 
 
 		 503 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  31.16 
 
 		 564 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  34.23 
 
 		 990 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  34.14 
 
 		 908 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  32.65 
 
 		 515 aa  247  4.9999999999999997e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  34.95 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2439  ribonuclease  32.32 
 
 		 499 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0019704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  32.39 
 
 		 636 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1831  ribonuclease  36.17 
 
 		 495 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2376  ribonuclease, Rne/Rng family  33.19 
 
 		 491 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  32.69 
 
 		 1117 aa  243  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  32.69 
 
 		 1265 aa  243  7e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  32.93 
 
 		 1043 aa  243  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  33.01 
 
 		 1041 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  30.77 
 
 		 496 aa  242  1e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  31.96 
 
 		 1007 aa  239  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  29.17 
 
 		 543 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  31.71 
 
 		 483 aa  238  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  32.93 
 
 		 1018 aa  237  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  32.93 
 
 		 922 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0357  ribonuclease, Rne/Rng family  31.41 
 
 		 537 aa  235  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  29.93 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  31.78 
 
 		 702 aa  234  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0321  ribonuclease  33.89 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.691253  normal  0.292271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  31.72 
 
 		 1244 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0537  ribonuclease E  31.66 
 
 		 486 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.155114  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  29.93 
 
 		 489 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  31.46 
 
 		 497 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  32.3 
 
 		 517 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  29.96 
 
 		 530 aa  233  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  35.43 
 
 		 713 aa  233  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  30.38 
 
 		 492 aa  233  9e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  30.4 
 
 		 489 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  31.03 
 
 		 1022 aa  232  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  32.13 
 
 		 1093 aa  232  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  34.91 
 
 		 645 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  34.91 
 
 		 687 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  30.86 
 
 		 489 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  31.23 
 
 		 1194 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  34.12 
 
 		 653 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  34.12 
 
 		 653 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  34.66 
 
 		 606 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  35.34 
 
 		 605 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19421  ribonuclease E/G  34.92 
 
 		 640 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.839153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  32.24 
 
 		 944 aa  230  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1067  RNAse E  34.67 
 
 		 640 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.232877  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  29.44 
 
 		 497 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  32.28 
 
 		 503 aa  229  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1353  ribonuclease E  33.26 
 
 		 938 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000765938  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  32.69 
 
 		 487 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  30.6 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  32.05 
 
 		 952 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  31.64 
 
 		 1427 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  33.92 
 
 		 602 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  30.59 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  32.78 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  32.36 
 
 		 1334 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  29.98 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  29.98 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  29.98 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  29.98 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  29.98 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  29.94 
 
 		 483 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  29.23 
 
 		 497 aa  228  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  29.98 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  34.29 
 
 		 808 aa  228  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  32.69 
 
 		 959 aa  228  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  29.98 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  29.98 
 
 		 489 aa  228  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  30.19 
 
 		 489 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  30.19 
 
 		 489 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>